TAX urn:sandre:dictionnaire:sa_tax::2002-1 Taxons 2007 2002-1 Référentiels France fra 2007-01-01 2008-06-23 2008-06-23 Evolution 1997 -> 2001 - suppression de la réglementation - Ajout du code Diatomés - Longueur du champ "Auteur du taxon" mis à 100 caractères Validé -----------------Entités----------------- TAXON Le taxon est une unité générique qui fait référence à la systématique. Cette science établit une classification des êtres vivants à partir de critères de ressemblance suivant une structure arborescente et hiérarchique à plusieurs niveaux (règne, embranchement, ordre, famille, genre, espèce...) dont chaque élément ou composante est qualifié de taxon. La liste des taxons est administrée par le SANDRE. Code du taxon Nom latin du taxon Statut du taxon Date de création du taxon Date de la dernière mise-à-jour du taxon Rédacteur de la fiche sur le taxon Nom commun du taxon Références bibliographiques sur le taxon Commentaires sur le taxon Auteur du taxon Niveau taxonomique du taxon Thème du taxon Est un élément de Code alternatif du taxon A pour synonyme CODE ALTERNATIF Le code alternatif est un code associé à un taxon, différent de celui de l'entité TAXON et par lequel un utilisateur peut accéder à une occurrence de cette dernière entité. Il ne s'agit pas de prendre en compte toutes les codifications qui existent mais de concilier des approches différentes. A titre d'exemple, il existe une codification nationale des poissons sur trois caractères. Cette codification, qui est rentrée dans les moeurs, ne peut être ignorée par le SANDRE. De même, chaque taxon est identifié par un code sur 8 positions dans la Banque Hydrobiologique et Piscicole (B.H.P.). Afin de rapprocher le dictionnaire national de celui de cette banque de données, il est nécessaire d'établir des correspondances. Identifiant du code alternatif Code alternatif Origine du code alternatif SYNONYME DU TAXON La 'paternité' d'un taxon est attribuée, selon la loi d'antériorité, à celui qui l'a décrit en premier. Or il arrive que la découverte attribuée à un chercheur soit remise en cause parce qu'on a constaté qu'un autre chercheur avait fait la description du même taxon plus tôt. Dans les faits, cela se traduit par un changement de nom du taxon qui possède alors plusieurs dénominations possibles dont une de référence. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises à jour successives de la fiche descriptive du taxon. Code du synonyme du taxon Synonyme du taxon THEME DES TAXONS Les thèmes des taxons sont une classification des taxons suivant leur nature et les utilisations qui en sont faites. Parmi les thèmes, on retrouve : Nomenclature : Code du thème des taxons / TAX / 2001 - 1 ---------------------------------------------------------------------- Code ! Mnémonique ! Libellé ---------------------------------------------------------------------- 0 ! Inconnu ! Thème inconnu 1 ! Poissons ! Poissons 2 ! Végétaux ! Végétaux 3 ! Invertébrés benthiques ! Invertébrés benthiques 4 ! Micro-organismes ! Micro-organismes 5 ! Diatomées ! Diatomées 6 ! Reptiles ! Reptiles ---------------------------------------------------------------------- Fin de la nomenclature La liste des thèmes des taxons relève de la responsabilité du SANDRE. Code du thème des taxons Libellé du thème des taxons NIVEAU TAXONOMIQUE Le niveau taxonomique fait référence à tous les niveaux systématiques énumérés dans la liste suivante : Le niveau taxonomique fait référence à tous les niveaux systématiques énumérés dans la liste suivante : Nomenclature : niveau taxonomique / TAX / 2001 - 1 ---------------------------------------------------------------------- Code ! Mnémonique ! Libellé ---------------------------------------------------------------------- 0 ! R ! Règne 1 ! E ! Embranchement 2 ! sE ! Sous-Embranchement 3 ! SCL ! Super-Classe 4 ! CL ! Classe 5 ! sCL ! sous-Classe 6 ! SO ! Super-Ordre 7 ! O ! Ordre 8 ! sO ! sous-Ordre 9 ! SF ! Super-Famille 10 ! F ! Famille 11 ! sF ! sous-Famille 12 ! T ! Tribu 13 ! G ! Genre 14 ! sG ! sous-Genre 15 ! sp ! Espèce 16 ! ssp ! sous-Espèce 17 ! iO ! infra-Ordre 18 ! iF ! infra-Classe ---------------------------------------------------------------------- Fin de la nomenclature La liste des niveaux taxonomiques est sous la responsabilité du SANDRE. La notion de groupe (G) qui n'est pas une entité reconnue par la systématique a également été introduite dans les niveaux taxonomiques pour des raisons pratiques. Elle représente suivant les cas définis par l'usage, des entités systématiques de niveaux différents. La liste des niveaux taxonomiques est sous la responsabilité du SANDRE. Abréviation taxonomique Niveau taxonomique -----------------Attributs----------------- Code du taxon Le code du taxon est un identifiant non signifiant sur six positions attribué par le SANDRE. Nom latin du taxon Tout taxon possède une appellation latine également qualifiée de nom scientifique. Pour éviter toute confusion à propos des espèces, celles-ci auront comme nom latin la composition du nom latin de l'espèce et du nom latin du genre. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Statut du taxon Nomenclature : Statut de validation / PAR / 2002 - 2 ---------------------------------------------------------------------- Code ! Mnémonique ! Libellé ---------------------------------------------------------------------- Gelé ! Gelé ! Gelé Proposition ! Proposition ! Proposition Provisoire ! Provisoire ! Provisoire Validé ! Validé ! Validé ---------------------------------------------------------------------- Gelé : ------ Une nomenclature ou un élément codifié d'une liste nationale SANDRE possède un statut GELE lorsqu'il a fait l'objet d'un travail de vérification de sa pertinence par un groupe d'experts du SANDRE, au regard des listes de références existantes. La conclusion de ce travail a mis en évidence une ou plusieurs erreurs pouvant être de nature variée (redondance d'informations, informations incomplètes, confusion) qui n'autorisent pas son usage au sein d'échanges de données. Une nomenclature ou une occurrence de listes nationales de statut gelé peut en outre évoluer à l'avenir vers un statut valide, toujours selon l'avis de groupes d'experts. Le statut GELE fait suite à un statut PROVISOIRE ou VALIDE. Proposition : ------------- Une nomenclature ou un élément d'une liste nationale SANDRE possède un statut PROPOSITION lorsque celui-ci parvient à la cellule d'animation du SANDRE par l'intermédiaire d'une fiche de proposition envoyée par un partenaire d'échange qui souhaite le soumettre à une codification nationale. Une nomenclature ou un élément ayant un statut PROPOSITION n'a pas encore été vérifié par un groupe d'experts ni codifié par le SANDRE. Il ne DOIT pas faire l'objet d'échanges de données et ne DOIT pas posséder pas de code SANDRE. Provisoire : ------------ Une nomenclature ou un élément d'une liste nationale SANDRE possède un statut PROVISOIRE lorsqu'il a fait l'objet d'une proposition par un partenaire d'échange ou un groupe d'experts avant d'être adressé à la cellule d'animation du SANDRE laquelle lui a attribué un code provisoire pour faliciter les échanges de données qui s'y raccordent. Une nomenclature ou un élément en statut PROVISOIRE est en attente de validation par un groupe d'experts lequel jugera de la pertinence de celui-ci, conformément aux règles d'usage des listes de référence SANDRE. Il PEUT dès lors faire l'objet d'échanges de données. Cependant, la reconnaissance de l'usage de ce code au sein d'échange de données ne revête pas un caractère officiel pour le SANDRE, ne garantissant pas la pertinence et la cohérence des données échangées qui s'y rapportent. Validé : -------- Une nomenclature ou un élément codifié d'une liste nationale SANDRE possède un statut VALIDE lorsqu'il a été jugé pertinent et cohérent aux yeux d'un groupe d'experts, garantissant ainsi son caractère valide. La nomenclature ou l'occurrence de listes nationales est bien reconnu officiellement par le SANDRE et PEUT désormais faire l'objet d'échanges de données. Fin de la nomenclature Gelé Gelé Une nomenclature ou un élément codifié d'une liste nationale SANDRE possède un statut GELE lorsqu'il a fait l'objet d'un travail de vérification de sa pertinence par un groupe d'experts du SANDRE, au regard des listes de références existantes. La conclusion de ce travail a mis en évidence une ou plusieurs erreurs pouvant être de nature variée (redondance d'informations, informations incomplètes, confusion) qui n'autorisent pas son usage au sein d'échanges de données. Une nomenclature ou une occurrence de listes nationales de statut gelé peut en outre évoluer à l'avenir vers un statut valide, toujours selon l'avis de groupes d'experts. Validé Validé Une nomenclature ou un élément codifié d'une liste nationale SANDRE possède un statut VALIDE lorsqu'il a été jugé pertinent et cohérent aux yeux d'un groupe d'experts, garantissant ainsi son caractère valide. La nomenclature ou l'occurrence de listes nationales est bien reconnu officiellement par le SANDRE et PEUT désormais faire l'objet d'échanges de données. Date de création du taxon La date de création du taxon est une date exprimée au jour près, à laquelle un taxon a été enregistré, avec le statut de 'code provisoire', dans la liste nationale des taxons (cf. statut du taxon). L'affectation d'une date de création à un taxon relève de la responsabilité du SANDRE. Date de la dernière mise-à-jour du taxon La date de la dernière mise-à-jour du taxon est la date exprimée au jour près, de la dernière mise-à-jour validée des informations portées sur la fiche de description du taxon. L'affectation de la date de la dernière mise-à-jour à un taxon relève de la responsabilité du SANDRE. Rédacteur de la fiche sur le taxon Le rédacteur de la fiche sur le taxon est le premier organisme à avoir demandé au SANDRE l'enregistrement du taxon. Le renseignement de cette donnée est obligatoire. Cet attribut ne sera pas actualisé à la suite des actualisations éventuelles de la fiche. L'attribution d'un auteur à un taxon relève de la responsabilité du SANDRE. Nom commun du taxon Le nom commun du taxon est le nom commun le plus couramment utilisé pour désigner le taxon. Le renseignement de cette donnée est facultatif car un taxon ne possède pas systématiquement de nom commun. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Références bibliographiques sur le taxon Les références bibliographiques doivent mentionner les sources documentaires ou autres qui contiennent toutes les informations nécessaires quant à l'identification et la détermination du taxon. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Commentaires sur le taxon Les commentaires sont des informations sur le taxon qu'il peut être intéressant de porter à la connaissance du lecteur et qui ne sont pas formalisées dans la fiche taxon. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Auteur du taxon L'auteur du taxon désigne la personne ainsi que la date à laquelle elle a décrit pour la première fois le taxon. La rédaction de cet attribut devra suivre la règle suivante : AUTEUR (ANNEE) où : AUTEUR = Nom de la personne qui décrit le première fois le taxon ANNEE = Année de la description Le renseignement de cette donnée est facultatif. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Identifiant du code alternatif Cet attribut (ou propriété) est un identifiant artificiel, non signifiant. Il est justifié par le fait qu'un code alternatif ne peut être identifiant de cette entité. En effet, un code alternatif n'est pas obligatoirement unique puisqu'il peut identifier une ou plusieurs occurrences différentes de l'entité TAXON dans au moins deux contextes différents. Code alternatif Le code alternatif est la valeur du code associé à un taxon dans un contexte particulier (Banque Hydrobiologique et Piscicole, Code Poisson, ...). Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises à jour successives de la fiche descriptive du taxon. Origine du code alternatif Code du synonyme du taxon Le code du synonyme est un identifiant artificiel non signifiant partiel. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises à jour successives de la fiche descriptive du taxon. Synonyme du taxon La 'paternité' d'un taxon est attribuée, selon la loi d'antériorité, à celui qui l'a décrit en premier. Or il arrive que la découverte attribuée à un chercheur soit remise en cause parce qu'on a constaté qu'un autre chercheur avait fait la description du même taxon plus tôt. Dans les faits, cela se traduit par un changement de nom du taxon qui possède alors plusieurs dénominations possibles dont une de référence. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises à jour successives de la fiche descriptive du taxon. Code du thème des taxons Le code du thème des taxons est un nombre attribué à chaque thème tel que défini dans la liste ci-après. Nomenclature : Code du thème des taxons / TAX / 2001 - 1 ---------------------------------------------------------------------- Code ! Mnémonique ! Libellé ---------------------------------------------------------------------- 0 ! Inconnu ! Thème inconnu 1 ! Poissons ! Poissons 2 ! Végétaux ! Végétaux 3 ! Invertébrés benthiques ! Invertébrés benthiques 4 ! Micro-organismes ! Micro-organismes 5 ! Diatomées ! Diatomées 6 ! Reptiles ! Reptiles ---------------------------------------------------------------------- Fin de la nomenclature La liste des thèmes des taxons relève de la responsabilité du SANDRE. Inconnu Thème inconnu Poissons Poissons Végétaux Végétaux Invertébrés benthiques Invertébrés benthiques Micro-organismes Micro-organismes Diatomées Diatomées Reptiles Reptiles Libellé du thème des taxons Le libellé du thème des taxons est le nom attribué à chaque thème tel que défini dans la liste ci-après. Nomenclature : Code du thème des taxons / TAX / 2001 - 1 ---------------------------------------------------------------------- Code ! Mnémonique ! Libellé ---------------------------------------------------------------------- 0 ! Inconnu ! Thème inconnu 1 ! Poissons ! Poissons 2 ! Végétaux ! Végétaux 3 ! Invertébrés benthiques ! Invertébrés benthiques 4 ! Micro-organismes ! Micro-organismes 5 ! Diatomées ! Diatomées 6 ! Reptiles ! Reptiles ---------------------------------------------------------------------- Fin de la nomenclature La liste des thèmes des taxons relève de la responsabilité du SANDRE. Abréviation taxonomique L'abréviation taxonomique est un code de trois positions maximum attribué à chaque niveau systématique tel que défini dans la liste suivante : Le niveau taxonomique fait référence à tous les niveaux systématiques énumérés dans la liste suivante : Nomenclature : niveau taxonomique / TAX / 2001 - 1 ---------------------------------------------------------------------- Code ! Mnémonique ! Libellé ---------------------------------------------------------------------- 0 ! R ! Règne 1 ! E ! Embranchement 2 ! sE ! Sous-Embranchement 3 ! SCL ! Super-Classe 4 ! CL ! Classe 5 ! sCL ! sous-Classe 6 ! SO ! Super-Ordre 7 ! O ! Ordre 8 ! sO ! sous-Ordre 9 ! SF ! Super-Famille 10 ! F ! Famille 11 ! sF ! sous-Famille 12 ! T ! Tribu 13 ! G ! Genre 14 ! sG ! sous-Genre 15 ! sp ! Espèce 16 ! ssp ! sous-Espèce 17 ! iO ! infra-Ordre 18 ! iF ! infra-Classe ---------------------------------------------------------------------- Fin de la nomenclature La liste des niveaux taxonomiques est sous la responsabilité du SANDRE. R Règne E Embranchement sE Sous-Embranchement SCL Super-Classe CL Classe sCL sous-Classe SO Super-Ordre O Ordre sO Sous-Ordre SF Super-Famille F Famille sF Sous-Famille T Tribu G Genre sG Sous-Genre sp Espèce ssp Sous-Espèce iO infra-Ordre iF infra-Classe V Variété sV Sous-variété Fo Forme sFo Sous-forme sR Sous-Règne Niveau taxonomique Le niveau taxonomique est le libellé de chaque niveau systématique tel que défini dans la liste suivante : La liste des niveaux taxonomiques est sous la responsabilité du SANDRE.