RHB urn:sandre:dictionnaire:sa_rhb::3.0 Processus d'acquisition des données biologiques 2008 Sandre; Groupe d'experts en hydrobiologie; Administrateurs de données Sandre 3.0 Eaux superficielles continentales France fra 2008-06-09 2019-06-04 2008-06-09 La version 3.0 du dictionnaire de données fait suite aux réflexions de normalisation de données biologiques émanant d'un groupe d'experts en hydrobiologie. Ce dictionnaire constitue un recueil de définitions de données. Il accompagne le second document de référence correspondant à la présentation générale des données biologiques, version 3.0. Les principales évolutions entre les versions 2.0->3.0 sont: - Ajout de l'entité SUPPORT - Création d'une association entre SUPPORT et OPERATION DE PRELEVEMENT et suppresion de l'attribut "Type d'opération de prélèvement biologique" de l'entité "OPERATION DE PRELEVEMENT" - Révision des définitions de l'ensemble des entités et attributs de manière à ce qu'elles soient plus conformes à l'ensemble des méthodes d'évaluation de la qualité biologique des milieux aquatiques. - Révision de certaines nomenclatures (Type de zones de faciès, substrats prélevés,...) - Ajout d'une association entre SUBSTRAT-ZONE DE FACIES - Ajout d'une association entre les entités UNITE DE MESURE-RESULTAT BIOLOGIQUE - Ajout d'une association entre PRELEVEMENT ELEMENTAIRE et TRANSECT - Modification de l'association entre TRANSECT-POINT DE PRELEVEMENT - Ajout des attributs "Classe de rives", "Présence Absence de zones de faciès" dans l'entité "ZONE DE FACIES" - Ajout de l'attribut "Code remarque sur le résultat biologique dans l'entité "RESULTAT BIOLOGIQUE" 2011-05-30: Correction apportée ajout de la nomenclature 477 SItuation particulière de l'opération de prélèvement 2019-06-04 correction du code de substrat GC par GG Validé -----------------Entités----------------- LISTE FAUNISTIQUE OU FLORISTIQUE Une liste faunistique ou floristique désigne : · soit la liste de résultats de l’identification et/ou du dénombrement de chaque taxon présent dans un ou plusieurs prélèvements élémentaires biologiques effectués au cours d'une même opération de prélèvement. · soit la liste de résultats de l’identification et/ou du recouvrement (estimation de la proportion d’occupation surfacique) de chaque taxon sur la zone prélevée. Ceci s’applique plus particulièrement pour le suivi du support macrophytes. Du point de vue terminologique, une liste est dite faunistique ou floristique selon que les principaux groupes taxonomiques dénombrés appartiennent respectivement au règne animal ou végétal. Une liste faunistique ou floristique regroupe un ensemble de taxons dénombrés issus d’un ou plusieurs prélèvements élémentaires. Ainsi, selon les protocoles, le nombre de listes varie. L’établissement des listes faunistiques ou floristiques est assuré par l’intervenant désigné comme déterminateur. Code de la liste faunistique ou floristique Libellé de la liste faunistique Commentaires sur la liste faunistique ou floristique Liste faunistique ou floristique OPERATION DE PRELEVEMENT BIOLOGIQUE Une opération de prélèvement biologique désigne un ensemble d’actions allant des prélèvements élémentaires biologiques effectuées par un organisme désigné comme préleveur sur les lieux d’un et d’un seul point de prélèvement (appartenant à une station de mesure) jusqu’au calcul de résultats d’indices biologiques, ceci au cours d'une période de temps continue. Une opération de prélèvement biologique est effectuée dans le cadre de l’application d’une seule et unique méthode d’évaluation de la qualité biologique des eaux superficielles continentales, au travers de l’étude d’un seul support biologique. Une opération de prélèvement biologique peut être faite dans le cadre d'un ou plusieurs réseaux de mesure selon un et seul protocole biologique (méthode biocénotique indicielle ou protocole standardisé) et donne lieu à la réalisation d’un ou plusieurs prélèvements élémentaires biologiques à partir desquels une ou plusieurs listes faunistiques ou floristiques sont établies, celles-ci permettant le calcul d’indices. Date du début de l'opération de prélèvement biologique Heure du début de l'opération de prélèvement biologique Date de la fin de l'opération de prélèvement biologique Heure de la fin de l'opération de prélèvement biologique Longueur du site prospectée Largeur moyenne de la lame d'eau Interprétation des résultats biologiques Qualification des résultats biologiques Statut des résultats biologiques Commentaires sur l'opération de prélèvement biologique Mode de conservation principal des échantillons Mode de conservation secondaire des échantillons Situation particulière des prélèvements biologiques Superficie mouillée totale Une opération de prélèvement hydrobiologique est faite dans le cadre de réseau(x) de mesure Une opération de prélèvement hydrobiologique s'effectue sur un point de prélèvement Détermine Préleveur de l'opération de prélèvement hydrobiologique Producteur des données hydrobiologiques Protocole utilisé Support biologique étudié Fait suite à Conditions environnementales mesurées pour l'opération de prélèvement hydrobiologique Décomposition du point de prélèvement en zones de faciès Prélèvement(s) biologique(s) Résultat(s) biologique(s) de l'opération de prélèvement PRELEVEMENT ELEMENTAIRE BIOLOGIQUE Un prélèvement élémentaire biologique correspond à une action visant à récolter ou relever la présence d’organismes vivants du support biologique étudié au cours d’une opération de prélèvement. Cette action est réalisée par l’organisme désigné comme préleveur. Un prélèvement élémentaire PEUT donner lieu à l’établissement d’une seule liste faunistique ou floristique au maximum. L’ensemble des prélèvements élémentaires d’une opération de prélèvement permet d’obtenir un échantillon cohérent et représentatif du point de prélèvement étudié. Code du prélèvement élémentaire hydrobiologique Matériel utilisé Végétation sur le prélèvement Type de colmatage de la placette Largeur prospectée Longueur prospectée Hauteur d'eau moyenne Surface prospectée Distance par rapport à la berge Volume d'eau prospecté Commentaires sur le prélèvement élémentaire biologique Intensité du colmatage de la placette Type de diatomées prélevées Faciès morphodynamique secondaire Groupe de prélèvements biologiques (bocal) Zone verticale prospectée Profondeur du prélèvement Prélèvement élémentaire étudié Zone(s) de faciès dans lequel le prélèvement est réalisé Substrat prélevé Condition(s) environnementale(s) d'un prélèvement biologique Prélèvement sur transect en plan d'eau CONDITIONS ENVIRONNEMENTALES DE L'OPERATION DE PRELEVEMENT BIOLOGIQUE Pour chaque opération de prélèvement biologique, des mesures de conditions environnementales peuvent être effectuées afin de déterminer certaines caractéristiques de l'environnement valables pour l’ensemble des actions réalisées au cours de l’opération de prélèvement, comme la température de l'air et les caractéristiques des berges, la situation hydrologique apparente,... La connaissance des conditions environnementales contribue à l’interprétation des résultats biologiques. En effet, elles peuvent influencer, voire biaiser les résultats obtenus. Date de la mesure de la condition environnementale de l'opération de prélèvement hydrobiologique Heure de la mesure de la condition environnementale de l'opération de prélèvement biologique Mesure de la condition environnementale de l'opération de prélèvement biologique Commentaires sur la mesure de la condition environnementale de l'opération de prélèvement biologique Qualification de la condition environnementale de l'opération de prélèvement biologique Statut de la mesure environnementale de l'opération de prélèvement biologique Paramètres mesurés pour connaître les conditions environnementales Méthode utilisée pour établir les conditions environnementales de l'opération de prélèvement hydrobiologique Unité de mesure de la mesure de la condition environnementale de l'opération de prélèvement biologique ZONE DE FACIES Une zone de faciès est une surface homogène du point de vue d’une caractéristique physique (vitesse du courant, substrat, profondeur,…). Il peut également s’agir d’une surface pour laquelle cette caractéristique physique s’inscrit dans les limites d’une classe donnée (exemple ; vitesse superficielle de l’eau comprise entre 5 et 25 cm/s). Une zone de faciès peut également être définie par un couple de caractéristiques physiques. Les faciès morphodynamiques, constituent un type particulier défini non pas par une grandeur physique ou un couple de grandeur physique clairement découpés en classes, mais par un ensemble de facteurs (vitesse du courant, profondeur, rapport de la hauteur d’eau à la granulométrie, type de profil en travers etc…) Au cours d’une opération de prélèvement biologique, relative à une méthode d’évaluation particulière de la qualité du milieu aquatique étudié, la connaissance de la diversité morphologique du point de prélèvement peut reposer sur la collecte d’informations descriptives des différents faciès qui composent ce point de prélèvement Les différents types de zone de faciès peuvent être également utilisés afin de relever les caractéristiques des différentes placettes ou sont réalisés les prélèvements élémentaires. Les deux types de relevés cités ci-dessus (relevés sur l’ensemble du point de prélèvement et/ou relevé sur chaque placette de prélèvement élémentaire) sont indépendants. Lorsqu’ils sont tous deux réalisés pour un type de zone de faciès donné, leur comparaison permet toutefois de juger de la représentativité de l’échantillonnage réalisé, voire de la conformité avec le protocole suivi. Une vérification de cohérence peut également être réalisée (un faciès prélevé doit, notamment, obligatoirement être présent sur le point de prélèvement si ce dernier a été entièrement décrit selon ce type de zone de faciès). Une zone de faciès PEUT donc être définie comme étant la plus petite unité descriptive d’un point de prélèvement, selon une variable physique particulière (éclairement, courant,…). Identifiant de la zone de faciès Type de zone de faciès Faciès de vitesse Faciès morphodynamique Faciès de courant Faciès de profondeur Faciès d'éclairement Faciès de rive Pourcentage de recouvrement Présence ou absence de la zone de faciès Classe de substrat SUBSTRAT Un substrat est un type de matériau minéral ou organique, inerte ou vivant, susceptible de supporter ou d’héberger des organismes biologiques. Pour les macrophytes, les substrats listés ci-dessous correspondent à ceux permettant de décrire les faciès. Les définitions des substrats (limites de tailles par exemple) pouvant varier d’un type d'opération à l’autre alors que leurs noms peuvent être identiques, les listes de substrats ont par conséquent été différenciées. La liste des substrats est définie dans la nomenclature n°274. Code du substrat Libellé du substrat STADE DE DEVELOPPEMENT Un résultat de dénombrement de taxons PEUT être donné pour un état morphologique particulier d'un taxon, correspondant à une de ses différentes phases de développement. Il est donc possible, au sein d’une liste, qu’un même taxon soit présent plusieurs fois, pour des stades de développement différent. Un résultat faunistique correspond généralement à un dénombrement d’individus pour tous les états morphologiques confondus (larvaire, adulte,…). La liste des stades de développement est définie dans la nomenclature sandre n°497. Note : l’Indice Biologique Global Normalisé (norme NF T 90-350, Décembre 1992) exige que les organismes soient dénombrés selon leur forme larvaire, nymphale ou adulte mais ne demande pas leur différenciation. Code du stade de développement Mnémonique du stade de développement Libellé du stade de développement Définition du stade de développement CONDITIONS ENVIRONNEMENTALES DU PRELEVEMENT ELEMENTAIRE BIOLOGIQUE A un prélèvement élémentaire biologique spécifique peuvent être associées une ou plusieurs valeurs environnementales complétant les informations sur le prélèvement. Ces conditions environnementales sont spécifiques à un prélèvement donné (à la différence des conditions environnementales associées à une opération de prélèvement). Remarque : le fait de pouvoir associer une mesure environnementale à un prélèvement élémentaire biologique permet de donner davantage de souplesse au modèle conceptuel de données. En effet, compte-tenu de la richesse sémantique pouvant être extraite de l’ensemble des méthodes d’évaluation de la qualité biologiques deux superficielles continentales, les données n’ayant pu être définies dans le dictionnaire actuel pourront éventuellement être bancarisées sous la forme de paramètres environnementaux. Date de la mesure de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique Heure de la mesure de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique Mesure de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique Commentaires sur la mesure de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique Qualification de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique Statut de la mesure environnementale du prélèvement élémentaire biologique Paramètre de la condition environnementale Méthode utilisée Unité de mesure de la mesure de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique Taxon dénombré Code remarque sur le résultat de liste faunistique Dénombrement de taxon Pourcentage de recouvrement du taxon Degré de confiance sur la détermination du taxon Densité par taxon Taxon pris en compte dans le calcul de l'indice Taxon dénombré Stade de développement du taxon dénombré Unité de mesure RESULTAT BIOLOGIQUE Outre les inventaires de taxons contenus dans les listes faunistiques ou floristiques, d’autres types de résultats biologiques peuvent être obtenus à l’issue d’une opération de prélèvement biologique. Il peut s’agir : · de résultats d’indices hydrobiologiques (ou biotiques) · de résultats de paramètres hydrobiologiques complémentaires ; exemple : « Groupe faunistique indicateur » (IBGN) ; métriques mesurées pour l’Indice Poission Rivière telles que le nombre d’espèces rhéophiles,…) L’ensemble de ces résultats (indices et métriques associées) est géré de manière identique et indifférenciée sous forme de paramètres hydrobiologiques. « Un indice biotique est une valeur numérique utilisée pour décrire le biote d’une masse d’eau, et utilisée pour en indiquer la qualité biologique » (source : T 90-503 « vocabulaire quadrilingue » ; Avril 1994). Note : l’indice biotique macroinvertébré élaboré par J. Verneaux en 1967 n’est qu’un indice biotique particulier (aujourd’hui historisé). Afin d’éviter toute confusion, le terme « indice biologique » est plus couramment utilisé. Les résultats d’indices biotiques sont généralement obtenus par calcul à partir des inventaires de taxons contenus dans les listes faunistiques ou floristiques. A noter que les résultats d’indices biologiques sont insuffisants pour comprendre l'état du milieu aquatique sur une station et ne sauraient remplacer l’interprétation des listes faunistiques ou floristiques par un hydrobiologiste, avec prise en compte des conditions de prélèvement, conditions environnementales, situation du point de prélèvement et de la station etc. Ces informations sont généralement établies par l'organisme qui détermine, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de ces données. Un indice biologique correspond à un paramètre hydrobiologique qualitatif, à savoir qu’il peut prendre un ensemble fini de valeurs numériques possibles comprises dans un intervalle borné. A l’intérieur de cet intervalle des classes de valeurs peuvent être définies dans le sens des valeurs numériques croissantes ou décroissantes, chaque classe correspondant à une appréciation globale de la qualité du milieu aquatique. Ces classes de qualité sont propres à chacune des méthodes biologiques. A noter qu’un même résultat d’indice biologique peut avoir des significations différentes au sujet de l’appréciation de la qualité du milieu aquatique concerné, l’interprétation du résultat étant fonction de la prise en compte d’un ensemble d’informations telles que : · la typologie du cours d’eau ou plan d’eau · la date de prélèvement · les conditions hydrologiques ayant précédé celui-ci · les conditions de déroulement de l’opération de prélèvement (hydrologie, météo, turbidité, conditions pratiques etc…) · la répartition des métriques associées · la morphologie de la station · les résultats de listes faunistiques ou floristiques · etc…. Outre les résultats d’indices biologiques, une opération de prélèvement biologique peut aboutir à l’obtention de résultats de paramètres hydrobiologiques complémentaires, pouvant entrer en ligne de compte dans l’appréciation globale de la qualité du milieu aquatique. Ces paramètres complémentaires peuvent correspondre à des variables globales (ou métriques), pris en compte dans la formule de calcul d’indices biologiques, et les résultats associés à ces paramètres complémentaires sont bien donnés à l’échelle de l’opération de prélèvement. Par exemple, dans le cadre du calcul de l’indice IBGN relatif au support « MACROINVERTEBRES BENTHIQUES », le niveau du groupe faunistique indicateur constitue un paramètre complementaire. Tout résultat biologique, qu’il s’agisse d’un résultat d’indice biologique ou d’un paramètre biologique complémentaire, DOIT être OBLIGATOIREMENT accompagné d’une unité de mesure, ceci même si le paramètre biologique en question est de type qualitatif, auquel cas l’unité de mesure codé « X » (sans objet) DOIT être utilisée. Accréditation du résultat biologique Résultat biologique Code remarque sur le résultat biologique Paramètre hydrobiologique Unité de mesure du résultat biologique Substrat prélevé Relation permettant de définir le ou les substrats prélevés dans le cadre d’un prélèvement élémentaire hydrobiologique et de préciser éventuellement le nombre de supports physiques pour ce substrat (en particulier pour les prélèvements de diatomées) et la stabilité du substrat prélevé Le nombre de supports physiques prélevés au cours d'un prélèvement varie selon les protocoles. Il est possible de renseigner le nombre d'occurence de supports (exemple: 5 blocs) et la stabilité du substrat. Pour les invertébrés, 8 prélèvements en IBGN avec un type de substrat par prélèvement, en cohérence avec la zone de faciès correspondante; 12 prélèvements dans le cadre du protocole de prélèvements des invertébrés lié au Réseau de contrôle de Surveillance. Pour les Diatomées, un prélèvement peut faire l'objet du prélèvement de différents substrats de même type (exemple, trois pierres et deux blocs). Nombre de supports prélevés Stabilité du substrat Substrat prélevé -----------------Attributs----------------- Code de la liste faunistique ou floristique Chaque liste faunistique/floristique est identifiée par un code sur la base d'un numéro d'ordre attribué pour une opération de prélèvement biologique donnée. Ce numéro sur deux positions est attribué par le biologiste chargé d'établir les listes, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est obligatoire. Libellé de la liste faunistique Le libellé de la liste faunistique est l'appellation explicite attribuée à chaque liste. Texte court décrivant la liste. Commentaires sur la liste faunistique ou floristique Ensemble des remarques que le biologiste peut formuler à propos des listes faunistiques/floristiques comme, par exemple, la difficulté de détermination, provoquée par la présence d’individus de petite taille.. Ce champ n’a pas vocation à recevoir des commentaires d’interprétation de la liste faunistique Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est optionnel. Date du début de l'opération de prélèvement biologique La date du début de l'opération de prélèvement biologique est la date, au jour près, à laquelle débute l'opération de prélèvement. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est obligatoire car elle rentre dans l'identifiant de l'opération de prélèvement. Heure du début de l'opération de prélèvement biologique L'heure du début de l'opération de prélèvement biologique est l'heure, à la minute près, à laquelle débute l'opération de prélèvement biologique. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est obligatoire car elle rentre dans l'identifiant de l'opération de prélèvement hydrobiologique. Date de la fin de l'opération de prélèvement biologique La date de la fin de l'opération de prélèvement biologique est la date, exprimée au jour près, à laquelle se termine l'opération de prélèvement biologique. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est optionnel. Heure de la fin de l'opération de prélèvement biologique L'heure de la fin de l'opération de prélèvement biologique est l'heure, à la minute près, à laquelle termine l'opération de prélèvement biologique. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est optionnel. Longueur du site prospectée Longueur exprimée en mètres, estimée ou mesurée par le préleveur au moment de l'opération de prélèvement biologique. Il s'agit de la longueur du tronçon prospecté du cours d'eau en vue d'y repérer les lieux de prélèvement demandés par le protocole utilisé. Les mesures biologiques effectuées sur ce tronçon seront réputées cohérentes avec les autres mesures (hydrobiologiques, physico-chimiques...) réalisées sur la longueur totale de la station qui est, par convention, de l'ordre de 10 fois la largeur du cours d'eau. Cette information est sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Cette longueur est fournie en mètres avec une précision métrique. Le renseignement de cette rubrique est optionnel. Largeur moyenne de la lame d'eau La largeur moyenne de la lame d'eau est la largeur du miroir le long du tronçon prospecté du cours d'eau. Elle est exprimée en mètres et estimée ou mesurée par le préleveur au moment de l'opération de prélèvement biologique. Cette information est sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est optionnel. Interprétation des résultats biologiques Les résultats biologiques sont un ensemble de valeurs (listes de taxons, indices…) obtenues à partir des recensements effectués sur les prélèvements élémentaires biologiques et à l'aide de calculs basés sur les formules et les abaques fournies par le protocole. Ces données élaborées gagnent à être accompagnées d'interprétations, prenant également en compte les paramètres environnementaux et les conditions de prélèvement et permettant d’établir une évaluation de la qualité du milieu aquatique. Cette information est établie sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est optionnel et porte sur l'ensemble de l'opération biologique. Qualification des résultats biologiques Deux attributs « Statut » et « Qualification » sont portés par l’entité « OPERATION DE PRELEVEMENT BIOLOGIQUE », selon les listes de valeurs citées précédemment. Ils indiquent l’état d’avancement de la validation de l’ensemble des données biologiques produites au cours des actions suivantes caractéristiques de l’opération de prélèvement : · les prélèvements biologiques · la description des zones de faciès · la composition des listes faunistiques/floristiques et la liste des taxons dénombrés · les résultats biologiques. La qualification de la donnée indique le niveau de la qualité de la donnée selon les valeurs définies dans la nomenclature n°414. Cette donnée est renseignée par le producteur. Par exemple, pour différencier une donnée « validée par un processus automatisée » d’une donnée « validée par un expert », il n’est pas créé deux niveaux de validation. Au contraire, dans les deux cas, la donnée est qualifiée « Correcte » mais elle est accompagnée d’une information complémentaire, le statut de la donnée, qui indique l’état d’avancement de cette validation : dans le premier cas, on indique le couple (CORRECTE, CONTROLE AUTOMATIQUE). Dans le second, il s’agit du couple (CORRECTE, EXPERT). Toute validation est toujours indiquée par ce couple. non définissable Qualification non définissable Une valeur sera non définissable lorsque le producteur est dans l'impossibilité d'obtenir les informations nécessaires pour évaluer la conformité de la donnée. Il s'agit par exemple de données historiques récupérées des archives dont on a perdu toute information sur la façon dont elles ont été produites. Correcte Correcte Une valeur est déclarée « Correcte » lorsque elle est estimée valide au stade de validation indiquée dans l'information « statut de la donnée » et vis-à-vis de la finalité recherchée. Incorrecte Incorrecte Une valeur est déclarée « Incorrecte » lorsque elle est estimée erronée au stade de validation indiqué dans l'information « statut de la donnée » et vis-à-vis de la finalité recherchée. Incertaine Incertaine Une valeur sera déclarée « Incertaine » si la validité de la donnée reste « douteuse » au stade de validation indiquée dans l'information « statut de la donnée ». Dans la mesure du possible, la qualification « Douteuse » doit être une étape transitoire de la validation de la donnée et doit être réservé à des avancements intermédiaires de la validation. Non qualifié Non qualifié Etat initial de la mesure qui n'a encore subi aucun audit ou interprétation du producteur de données en vue de sa validation. Statut des résultats biologiques Deux attributs « Statut » et « Qualification » sont portés par l’entité « OPERATION DE PRELEVEMENT BIOLOGIQUE », selon les listes de valeurs citées précédemment. Ils indiquent l’état d’avancement de la validation de l’ensemble des données biologiques produites au cours des actions suivantes caractéristiques de l’opération de prélèvement : · les prélèvements biologiques · la description des zones de faciès · la composition des listes faunistiques/floristiques et la liste des taxons dénombrés · les résultats biologiques. Le statut de la donnée indique ensuite l’état d’avancement de la validation des données selon les valeurs définies dans la nomenclature n°446. Donnée brute Donnée brute Données issues du processus d¿acquisition n¿ayant subi aucun examen. Ex. : donnée directement issue de l¿appareil de mesure Niveau 1 Donnée contrôlée niveau 1 (données contrôlées) Le producteur examine les résultats par rapport à la connaissance qu¿il a sur la station et le point de prélèvement. Exemple : comparaison par rapport à des seuils min-max classiquement rencontrés sur le point, utilise un système expert qui compare les résultats entre eux. Niveau 2 Donnée contrôlée niveau 2 (données validées) Le producteur regarde et vérifie l¿ensemble de la chaîne d¿acquisition et la cohérence des données (par exemple : depuis le prélèvement, conditionnement, flaconnage, transport, mesure en laboratoire). Donnée interprétée Donnée interprétée La valeur a été utilisée dans un rapport ou valorisée. Cette mise en perspective de l¿information permet de consolider son niveau de validité et détecter les dernières erreurs. Par exemple : diagrammes binaires, comparaison faciès, etc¿. Commentaires sur l'opération de prélèvement biologique Ensemble des remarques que le préleveur, le détermineur (qui pourra également renseigner préférentiellement le champ commentaire de la liste faunistique) et le producteur de données souhaitent faire à propos de l'opération de prélèvement biologique réalisée ainsi que de sa validation. Le renseignement de cette rubrique est optionnel. Mode de conservation principal des échantillons Mode de conservation principal des échantillons de substrats prélevés au cours de l'ensemble des prélèvements effectués lors d'une opération de prélèvements, selon les valeurs possibles définies dans la nomenclature n°476. Inconnu Inconnu Congélation Congélation Dessication Dessication Alcool Alcool Formol Formol (formaldéhyde) Lugol Lugol Liquide de Sémichon Liquide de Sémichon Mode de conservation secondaire des échantillons Mode de conservation secondaire des échantillons de substrats prélevés au cours de l'ensemble des prélèvements effectués lors d'une opération de prélèvements, selon les valeurs possibles définies dans la nomenclature n°476. Inconnu Inconnu Congélation Congélation Dessication Dessication Alcool Alcool Formol Formol (formaldéhyde) Lugol Lugol Liquide de Sémichon Liquide de Sémichon Situation particulière des prélèvements biologiques La situation particulière du prélèvement biologique permet d’indiquer les prélèvements réalisés en des lieux, situations, ou sur des supports très particuliers La liste des valeurs autorisées par le Sandre est définie dans la nomenclature n°477. Z. b. vagues Zone battue par les vagues Paroi écluse ex Paroi d'écluse exondée Paroi écluse in Paroi d'écluse inondée Z. interdidale ex Zone interdidale exondée Z. interdidale in Zone interdidale inondée Suintements Suintements Milieux temporaires Milieux temporaires Crue z. récent in Crue zone récemment inondée Décrue z. récent ex Décrue ou zone récemment exondée Bouée, embarcation Bouée, flotteur embarcation Piles de pont Piles de pont Crête barrage, seuil Crêtes de barrage, seuil déversoirs Animaux aquatiques Sur animaux aquatiques Contenus stomacaux Contenus stomacaux ou intestinaux Carottages Carottages Tourbières Tourbières Zones ombragées Zones ombragées Aval barrage z ex Aval barrage ou écluse, zone exondée Aval barge z recent in Aval barrage ou écluse, zone récemment inondée Zone de marnage Zone de marnage (sans précision) Amont seuil écluse Amont seuil barrage ou écluse Aval seuil écluse Aval seuil barrage ou écluse Superficie mouillée totale La superficie mouillée totale d'un point de prélèvement, exprimée en mètre carré, est estimée en calculant le produit entre la longueur totale du point de prélèvement (en mètre) et la largeur moyenne de la lame d'eau (en mètre). Cette superficie mouillée totale conditionne l'identification des substrats dominants (superficie totale de chaque substrat supérieure à 5% de la superficie mouillée totale) et des substrats marginaux représentatifs (superficie totale de chaque substrat inférieure ou égale à 5% de la superficie mouillée totale) Code du prélèvement élémentaire hydrobiologique Code attribué par le préleveur à chaque prélèvement élémentaire biologique effectué sur un point de prélèvement au cours d'une opération de prélèvement biologique. Il s'agit d'un numéro d'ordre sur deux positions qui débute à 1 à chaque nouvelle opération de prélèvement biologique. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est obligatoire. Matériel utilisé Matériel principal utilisé pour le prélèvement des différents substrats, selon les valeurs définies dans la nomenclature n°451. Inconnu Inconnu Brosse Brosse Binette Binette Couteau Couteau ou scalpel Mains Expression manuelle Pipette Pipette Surber Surber Haveneau Haveneau Drague circulaire Drague circulaire Drague triangulaire Drague triangulaire Benne automatique Benne à fermeture automatique (Eckman, Friedinger) Piochon Piochon Substrat artificiel Substrat artificiel Bouteille intégratrice Bouteille intégratrice Bouteille Van Dorn Bouteille Van Dorn Pompe Pompe Carottier Carottier Filet indéterminé Filet indéterminé Surber ou haveneau Drague indéterminé Drague indéterminé Circulaire ou triangulaire Végétation sur le prélèvement La végétation de la placette est un texte libre précisant le contenu végétatif sur la zone de prélèvement. Elle est déterminée par le préleveur. Notons que cette information est uniquement informative et ne doit pas être utilisée pour décrire une liste floristique détaillée. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est optionnel. Type de colmatage de la placette Indication fournie par le préleveur sur la nature du dépôt présent entre les particules minérales reposant sur le fond de l'endroit où est effectué le prélèvement élémentaire biologique. Les valeurs possibles sont définies dans la nomenclature n°56. Le renseignement de cette rubrique est optionnel. inconnu Colmatage inconnu Pas de colmatage Pas de colmatage Sables Sables Particules minérales dont la granulométrie est comprise entre 62,5 µm à 2 mm (selon la notice de l'attribut granulométrique du Sandre) et qui constitue un élément rapporté par rapport à la granulométrie de référence du site. Vases Vases Concept limité aux dépôts d'origine organique, en décomposition avancée, d'aspect colloïdal. Se reconnaît à sa couleur noirâtre tranchée et, le cas échéant, à l'odeur caractéristique due à l'anaérobiose. (En pratique on trouvera soit des vases provenant de rejets urbains soit des vases provenant de la décomposition de litières, dans ce dernier cas on peut trouver tous les états intermédiaires entre la litière et la vase). Sédiments fins Sédiments fins Dépôt d'éléments organiques ou minéraux fins, parfois floculeux pouvant facilement être remis en suspension. Formations biologiques Formations biologiques Développement de bactéries, de champignons (plus rare) ou d'algues en colonies (diatomées) formant des pellicules organiques de quelques millimètres d'épaisseur sur les surfaces dures (pierres) ou encore développement d'algues en gazon, en coussinets ou filamenteuses. végétaux grossiers Débris végétaux grossiers Eléments végétaux morts de taille notable dont le diamètre est de l'ordre du centimètre (branchettes, brindilles, écorces...). Litières Litières Dépôts de feuilles et de tiges encore structurées. Dépôts Dépôts incrustant Précipitation d'origine chimique ou biologique formant des croûtes solides sur les substrats et pouvant aller jusqu'à la formation de dalles incluant graviers, débris végétaux. Exemples : - Tuff, - dépôts calcaires Largeur prospectée La largeur prospectée indique la largeur prélevée le long du tronçon prospecté du cours d'eau. Elle est exprimée en mètres et estimée ou mesurée par le préleveur au moment du prélèvement biologique. Cette information est différente de la largeur prospectée sur l'ensemble de l'opération de prélèvement. Cette information est sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Longueur prospectée La longueur prospectée est la longueur étudiée pour un prélèvement élémentaire donné. Cette longueur est fournie en mètres avec une précision métrique. Hauteur d'eau moyenne La hauteur d'eau moyenne est la hauteur moyenne exprimée en mètres, estimée ou mesurée par le préleveur, de la lame d'eau sur la zone où est effectué le prélèvement élémentaire biologique. Cette information est sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est optionnel. Surface prospectée La surface prospectée est la surface exprimée en mètres carrés sur laquelle sont prélevés les taxons au droit de la placette. En général, la surface est de 1/10e ou de 1/20e de mètre carré. Cette information est sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Le renseignement de cette rubrique est optionnel. Distance par rapport à la berge Distance à la berge du bord le plus proche de l’outil de prélèvement ou du substrat prélevé lorsqu’aucun outil n’est utilisé. (on a donc zéro lorsque le prélèvement touche le bord du cours d’eau) Valeur numérique à une décimale, exprimée en mètres. Volume d'eau prospecté Le volume d’eau prélevé est le volume d'eau, exprimé en litre, recueilli lors du prélèvement ou bien du volume correspondant au trait de filet réalisé (section du filet x longueur du trait). Ce volume d’eau prélevé peut être différent du volume d’eau analysé, si des sous-échantillonnages sont effectués. Commentaires sur le prélèvement élémentaire biologique Ensemble des remarques que le préleveur souhaite faire à propos du prélèvement élémentaire biologique, tel que le temps minimum et maximum indicatifs pour le tri et la quantification d'un seul prélèvement unitaire pour un type de substrat donné. Cette information est sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Intensité du colmatage de la placette Intensité de la nature du dépôt présent entre les particules minérales reposant sur le fond de l'endroit où est effectué le prélèvement élémentaire biologique. Les valeurs possibles sont définies dans la nomenclature n°469. abs. Colm Pas de colmatage très léger Très léger colmatage léger Léger colmatage moyen Colmatage moyen important Colmatage important complet Colmatage complet présence Présence de colmatage non caractérisé Type de diatomées prélevées Le type de diatomées prélevées précise dans quel habitats ont été prélevées les diatomées La liste de valeurs autorisée par le Sandre est celle définie dans la nomenclature n°479. Inconnu Inconnu ou indéterminé Epilithon Epilithon Epipsammon Epipsammon Epipélon Epipélon Epimicrophyton Epimicrophyton Epimacrophyton Epimacrophyton Périphyton naturel Périphyton naturel (s.l) Périphyton artificiel Périphyton artificiel Plancton Plancton Zoophyton Zoophyton Diatomées fossiles Diatomées fossiles Composite Composite Epidendrophyton Epidendrophyton Faciès morphodynamique secondaire Le faciès morphodynamique est une zone à l'intérieur d'une station déterminée par certaines caractéristiques de vitesse de courant et de profondeur, qui peuvent être considérées comme identiques sur toute sa surface. Cependant, certains faciès particuliers peuvent être rencontrés au sein de faciès plus étendus : par exemple zone de bordure d’un radier, encoche de berge d’un plat etc… La liste reprend l’intégralité des faciès, même si certains d’entre eux seulement peuvent être présents en tant que faciès secondaires Suivant les besoins du protocole utilisé, il sera décrit par le préleveur à l'aide de l'un des éléments de la liste définie dans la nomenclature n°53. Biblio explicative de la liste des faciès : - Malavoi J.R. & Souchon Y., 2002 - Description standardisée des principaux faciès d’écoulement observable en rivière Note technique - Bulletin Français de Pêche et de Pisciculture, 365/366 : 357-372. - MALAVOI, 1989 - Typologie des faciès d’écoulement ou unités morphodynamiques des cours d’eau à haute énergie - Bulletin Français de Pêche et de Pisciculture, 315 : 189-210. Les deux faciès indéterminable sont à réserver aux cas ou la turbidité de l’eau ne permet pas l’identification du faciès inconnu Faciès morphodynamique inconnu Ch. Lotique Chenal lotique Ecoulement lotique profond, à profil symétrique, profil en long pas de situation particulière Ch. Lentique Chenal lentique Ecoulement lentique profond, à profil symétrique, profil en long souvent en amont d'un obstacle ou d'un faciès de type radier ou rapide. Bordure Zone de bordure A réserver aux zones littorales d'une largeur significative et de caractéristiques de courant, de granulométrie et/ou de profondeur différentes du reste du lit (ne pas doubler avec encoche de bordure) morte Eau morte ou lône Partie en eau plus ou moins déconnectée (souvent connectée par l'aval seulement) du lit principal. Courant Courant Données historiques Plat lent. Plat lentique Anciennement désigné par « Plat ».: écoulement lentique peu profond , à profil symétrique, profil en long souvent en amont d’un obstacle ou d’un faciès de type radier ou rapide. Mouille Type Mouille Grand Type qui comprend les codes de faciès morphodynamique 2, 19, 18, 20 et 1. Plat courant Plat courant Ecoulement lotique peu profond, à profil symétrique, profil en long pente douce, écoulement uniforme,vaguelettes à la surface de l’eau liées à la présence du substrat à proximité de la surface libre. Rugosité relative H/S50 ~ 3 à 4 (H = hauteur d’eau, S50 = petit axe du D50, diamètre médian du substrat Radier Radier Ecoulement lotique peu profond, à profil symétrique, profil en long pente plus forte, rupture de pente plus nette avec les faciès limitrophes.Turbulence plus forte liée à l’affleurement du substrat au ras de la surface libre. Rugosité relative H/S50 ~ 2 à 3 Rapide Rapide Ecoulement lotique peu profond, à profil symétrique, profil en long faciès à forte pente et forte turbulence matérialisée par de l'écume blanche 1,2<H/S50<2 Escalier Escalier Faciès intermédiaire entre Rapide et Cascade+Fosse de dissipation, caractérisé par des rides transversales de blocs (perpendiculaires à l'écoulement) de 20 à 40cm de hauteur, espacés régulièrement de 1 à plusieurs mètres. Cascade Cascade Ecoulement lotique peu profond, à profil symétrique, profil en long dénivelé de 0,5 à 1,5m. Souvent associé à une fosse de dissipation Chute Chute Ecoulement lotique peu profond, à profil symétrique, profil en long dénivelé > 1,5 m. Souvent associé à une fosse de dissipation lentique indeterm Faciès lentique indéterminable Réservé au cas où il n'est pas possible de se prononcer (accès non possible à la zone et fonds non visibles). Qualification selon la seule vitesse de courant superficielle lotique indéterm Faciès lotique indéterminable Réservé au cas où il n'est pas possible de se prononcer (accès non possible à la zone et fonds non visibles). Qualification selon la seule vitesse de courant superficielle. Anciennement désigné par « Courant » dans la liste des faciès morphodynamiques du SANDRE. - Chenal lotique : Ecoulement lotique de profondeur >60cm Banc de convexi Banc de convexité Atterrissement situé dans la partie interne d'un méandre. Partage généralement le profil en travers du cours d'eau avec un mouille de concavité. A n'utiliser que si une partie du banc est immergée. Mouille de concavi Mouille de concavité Ecoulement lentique profond, à profil asymétrique, profil en long Mouille (h>60cm) située dans la concavité d'un méandre. Partage généralement le profil en travers du cours d'eau avec un banc de convexité (immergé ou non) Fosse de dissipation Fosse de dissipation Ecoulement lentique profond, à profil symétrique, profil en long Fosse (h>60cm) située immédiatement à l'aval d'une cascade ou d'une chute. Fosse d’affouillement Fosse d’affouillement Ecoulement lentique profond, à profil asymétrique, profil en long Creusement (h>60cm) le long d'un obstacle à l'écoulement (embacles, rochers, piles de pont…) Sous-berge Sous-berge Zone située sous un surplomb de la berge ou de racines denses Encoche Encoche de bordure Encoche en berge de caractéristiques de courant, de granulométrie et/ou de profondeur différentes du reste du lit. Radier/Rapide Type radier / rapide Grand Type qui comprend les codes de faciès morphodynamique 9, 10, 12 et 13. Groupe de prélèvements biologiques (bocal) Le groupe de prélèvements biologiques est une information se rapportant uniquement au protocole de prélèvements des invertébérés sur le Réseau de Surveillance. Il désigne, à l'aide de l'un des codes suivants, le groupe de 4 prélèvements réalisés sur le terrain en respectant certaines règles telles que définies dans le protocole. "Dans la norme IBGN, comme dans le protocole AQEM, la prospection de substrats différents est nettement privilégiée. Cependant, la vitesse du courant est également un facteur important de diversification des peuplements d’invertébrés benthiques et doit être intégrée dans les règles d’échantillonnage. On cherchera également à bien répartir les prélèvements sur l’ensemble de la station. En pratique, cela signifie : - Identifier sur le terrain les supports dominants (superficie > 5%) et marginaux (= 5%) ; - Réaliser un premier groupe de 4 prélèvements sur les supports marginaux, suivant l’ordre d’habitabilité (bocal 1) ; - Réaliser un deuxième groupe de 4 prélèvements sur les supports dominants, suivant l’ordre d’habitabilité (bocal 2) ; - Réaliser un troisième groupe de 4 prélèvements sur les supports dominants, en privilégiant la représentativité des habitats (bocal 3)." (source: protocole de prélèvement des Invertébrés sur le Réseau de Surveillance; 30 mars 2007) La liste des valeurs possibles est définie dans la nomenclature n°480. Bocal 1 Bocal 1 Premier groupe de 4 prélèvements biologiques d'invertébrés, sur les supports marginaux, suivant l’ordre d’habitabilité (bocal 1) Bocal 2 Bocal 2 Deuxième groupe de 4 prélèvements biologiques d'invertébrés sur les supports dominants, suivant l’ordre d’habitabilité (bocal 2) Bocal 3 Bocal 3 Troisième groupe de 4 prélèvements biologiques d'invertébrés sur les supports dominants, en privilégiant la représentativité des habitats (bocal 3) Zone verticale prospectée La zone verticale prospectée indique la zone où a été effectuée le prélèvement biologique selon la nomenclature administrée par le Sandre. Cette information peut être complétée par une profondeur exacte indiquée dans l’information ‘Profondeur du prélèvement’. La liste des valeurs possibles est définie dans la nomenclature n°430. Inconnu Inconnu Zone euphotique Zone euphotique Zone d'un plan d'eau s'étendant depuis la surface jusqu'à une profondeur égale à 2,5 fois la transparence mesurée au disque de Secchi. Hypolimnion Hypolimnion Couche d’eau qui, dans une masse d’eau stratifiée, est située sous le thermocline. Source norme T 90-501. Thermocline Thermocline Zone intermédiaire d'un plan d'eau, en dessous de la couche superficielle et dans laquelle on observe un fort gradient vertical de la température. L¿information « profondeur » permet facultativement de pr??ciser la profondeur de la thermocline. Prélèvement intégré Prélèvement intégré Prélèvement moyen à fins d'analyses, représentatif d'une zone précise d'un plan d'eau (thermocline ou colonne d'eau totale). Il est obtenu soit directement par des dispositifs intégrateurs (par exemple : bouteille "Pelletier") soit indirectement par mélange à proportions égales de 5 prélèvements ponctuels équidistants dans la zone considérée. Aucune profondeur ne doit être indiquée. Prélèvement de fond Prélèvement de fond Prélèvement réalisé au niveau du fond du plan d¿eau. L¿information « profondeur » permet facultativement de préciser la profondeur du fond. Prélèvement ponctuel Prélèvement ponctuel de profondeur quelconque Il s¿agit d¿un prélèvement ponctuel à fins d'analyses, effectué à une profondeur quelconque. Il est recommandé de préciser dans l¿information « profondeur » la profondeur du prélèvement. Prélèvement intégré Prélèvement intégré sur le plan d'eau Prélèvement moyen réalisé à plusieurs profondeurs du plan d¿eau ET dans plusieurs lieux de prélèvement. Aucune profondeur ne doit être indiquée. Epilimnion Epilimnion Strate thermique supérieure de l’eau d'un plan d’eau. Couche superficielle, chaude, où les courants produits par le vent en surface peuvent librement se mouvoir et où le gradient de température est faible quoique variable. Partie d’un biotope limnique (lac, par exemple) constituée par la couche superficielle des eaux située au dessus de la thermocline. Profondeur du prélèvement La profondeur indique la profondeur exacte du prélèvement en mètres lorsque l’information « Zone verticale prospectée »est égale à : « Prélèvement ponctuel de profondeur intermédiaire » : profondeur du prélèvement (obligatoire) « Prélèvement de fond : Précision possible de la profondeur de fond (si connu) « Hypolimnion » : Précision possible de la profondeur de l’hypolimnion (si connu) « Thermocline » : Précision possible de la profondeur de la thermocline (si connu) Dans le cadre de l'application de la méthodologie d’étude des communautés de macrophytes en plans d’eau, un prélèvement élémentaire peut correspondre à un relevé floristique effectué sur un point contact d’un transect transversal (profil perpendiculaire à la rive), la profondeur de chaque point contact étant à renseigner au niveau de cet attribut « Profondeur du prélèvement » Date de la mesure de la condition environnementale de l'opération de prélèvement hydrobiologique La date de la mesure de la condition environnementale d'une opération de prélèvements biologiques est la date au jour près à laquelle a débuté la mesure de la condition environnementale. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Heure de la mesure de la condition environnementale de l'opération de prélèvement biologique L'heure de la mesure de la condition environnementale d'une opération de prélèvements biologiques est l'heure à laquelle a débuté la mesure de la condition environnementale. L'heure est arrondie à la minute la plus proche. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Mesure de la condition environnementale de l'opération de prélèvement biologique La mesure de la condition environnementale d'une opération de prélèvements biologiques est soit la valeur du résultat du paramètre quantitatif, soit le code de la valeur possible du paramètre qualitatif. Le résultat du paramètre quantitatif est exprimé dans l'unité de mesure définie pour le paramètre mesuré avec 5 chiffres significatifs au maximum. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Commentaires sur la mesure de la condition environnementale de l'opération de prélèvement biologique Les commentaires sur les mesures des conditions environnementales d'une opération de prélèvements biologiques comportent toutes les remarques éventuelles de l'organisme à propos de la mesure qu'il a effectuée. Qualification de la condition environnementale de l'opération de prélèvement biologique Compte-tenu que les conditions environnementales peuvent être des paramètres assez généraux plus ou moins indépendants des résultats de l'opération de prélèvement proprement dite (description des zones de faciès, composition des listes faunistiques, résultats biologiques), le processus de validation des mesures environnementales par le producteur de données est distinct de celui propre aux résultats de l’opération de prélèvement biologique. Ceci est valable pour les conditions environnementales liées à l’opération de prélèvement mais aussi à celles liées à chaque prélèvement élémentaire. La validation des mesures environementales s’appuie également sur les deux attributs « Statut » et « Qualification » citées précédemment. La qualification de la donnée indique le niveau de la qualité de la donnée selon les valeurs définies dans la nomenclature n°414. Cette donnée est renseignée par le producteur. Par exemple, pour différencier une donnée « validée par un processus automatisée » d’une donnée « validée par un expert », il n’est pas créé deux niveaux de validation. Au contraire, dans les deux cas, la donnée est qualifiée « Correcte » mais elle est accompagnée d’une information complémentaire, le statut de la donnée, qui indique l’état d’avancement de cette validation : dans le premier cas, on indique le couple (CORRECTE, CONTROLE AUTOMATIQUE). Dans le second, il s’agit du couple (CORRECTE, EXPERT). Toute validation est toujours indiquée par ce couple. non définissable Qualification non définissable Une valeur sera non définissable lorsque le producteur est dans l'impossibilité d'obtenir les informations nécessaires pour évaluer la conformité de la donnée. Il s'agit par exemple de données historiques récupérées des archives dont on a perdu toute information sur la façon dont elles ont été produites. Correcte Correcte Une valeur est déclarée « Correcte » lorsque elle est estimée valide au stade de validation indiquée dans l'information « statut de la donnée » et vis-à-vis de la finalité recherchée. Incorrecte Incorrecte Une valeur est déclarée « Incorrecte » lorsque elle est estimée erronée au stade de validation indiqué dans l'information « statut de la donnée » et vis-à-vis de la finalité recherchée. Incertaine Incertaine Une valeur sera déclarée « Incertaine » si la validité de la donnée reste « douteuse » au stade de validation indiquée dans l'information « statut de la donnée ». Dans la mesure du possible, la qualification « Douteuse » doit être une étape transitoire de la validation de la donnée et doit être réservé à des avancements intermédiaires de la validation. Non qualifié Non qualifié Etat initial de la mesure qui n'a encore subi aucun audit ou interprétation du producteur de données en vue de sa validation. Statut de la mesure environnementale de l'opération de prélèvement biologique Compte-tenu que les conditions environnementales peuvent être des paramètres assez généraux plus ou moins indépendants des résultats de l'opération de prélèvement proprement dite (description des zones de faciès, composition des listes faunistiques, résultats biologiques), le processus de validation des mesures environnementales par le producteur de données est distinct de celui propre aux résultats de l’opération de prélèvement biologique. Ceci est valable pour les conditions environnementales liées à l’opération de prélèvement mais aussi à celles liées à chaque prélèvement élémentaire. La validation des mesures environementales s’appuie également sur les deux attributs « Statut » et « Qualification » citées précédemment. Le statut de la donnée indique ensuite l’état d’avancement de la validation des données selon les valeurs définies dans la nomenclature n°446. Donnée brute Donnée brute Données issues du processus d¿acquisition n¿ayant subi aucun examen. Ex. : donnée directement issue de l¿appareil de mesure Niveau 1 Donnée contrôlée niveau 1 (données contrôlées) Le producteur examine les résultats par rapport à la connaissance qu¿il a sur la station et le point de prélèvement. Exemple : comparaison par rapport à des seuils min-max classiquement rencontrés sur le point, utilise un système expert qui compare les résultats entre eux. Niveau 2 Donnée contrôlée niveau 2 (données validées) Le producteur regarde et vérifie l¿ensemble de la chaîne d¿acquisition et la cohérence des données (par exemple : depuis le prélèvement, conditionnement, flaconnage, transport, mesure en laboratoire). Donnée interprétée Donnée interprétée La valeur a été utilisée dans un rapport ou valorisée. Cette mise en perspective de l¿information permet de consolider son niveau de validité et détecter les dernières erreurs. Par exemple : diagrammes binaires, comparaison faciès, etc¿. Identifiant de la zone de faciès L'identifiant de la zone de faciès est un numéro sans signifiance indiqué lors des échanges de données sur la description de zones de faciès. Ce identifiant est numérique et doit être unique pour l’opération de prélèvement biologique. Ce identifiant relève de la responsabilité du producteur de l’opération de prélèvement biologique. Type de zone de faciès Le type de faciès précise la catégorie de faciès décrit dans la zone de faciès. La liste de valeurs possibles est définie dans la nomenclature n°449. vitesse / substrat Couple substrat/vitesse Combinaison des deux facteurs substrat et vitesse décrits ci-dessous, en fonction de leurs typologies respectives. courant Faciès de Courant « Faciès lentique : partie de cours d’eau présentant une faible vitesse de courant. Faciès lotique : partie de courant présentant une forte vitesse de courant [tiré de la norme IBMR NF T90-395 octobre 2003]. Les diatomistes ont subdivisé ces deux classes.(voir nomenclature ci-après) La liste des classes de faciès de courant est définie dans la nomenclature n°54. morphodynamique Faciès morphodynamique Parties de cours d’eau présentant des caractéristiques relativement homogènes de vitesse, granulométrie, profondeur, profil en travers… (Document de référence : « Malavoi J.R. & Souchon Y. », 2002 - Description standardisée des principaux faciès d’écoulement observable en rivière Note technique - Bulletin Français de Pêche et de Pisciculture, 365/366 : 357-372.) La liste des classes de faciès morphodynamique est définie dans la nomenclature n°53. profondeur Profondeur Profondeurs d’eau observées, correspondant à la hauteur entre la surface de l'eau et le fond du cours d'eau ou plan d’eau, selon une typologie prédéfinie. La liste des classes de faciès de profondeur est définie dans la nomenclature n°450. substrat Substrat Un substrat est un type de matériau minéral ou organique, inerte ou vivant, susceptible de supporter ou d’héberger des organismes biologiques. La liste des classes de faciès de substrat est définie dans la nomenclature n°274. vitesse Vitesse Vitesses moyennes d’écoulement de l’eau observées, selon une typologie prédéfinie. La liste des classes de faciès de vitesse est définie dans la nomenclature n°278. Eclairement Eclairement Intensités d'éclairement observées selon une typologie prédéfinie. La liste des classes de faciès d'éclairement est définie dans la nomenclature n°500. Rives Rives La classe de rive se rapporte à une typologie de description d’un plan d’eau (typologie de rives des unités d'observation) définie dans la méthodologie d'étude des communautés de macrophytes en plans d'eau (Novembre 2007, CEMAGREF). La liste des classes de faciès de courant est définie dans la nomenclature n°536. Substr Courant Couple susbtrat/ faciès de courant Combinaison des deux facteurs substrat et courant (lotique/lentique), en fonction de leurs typologies respectives. Vitesse Courant Couple vitesse/ faciès de courant Combinaison des deux facteurs vitesse et faciès de courant (lotique/lentique), en fonction de leurs typologies respectives. (utilisé pour l’IBMR) Eclaire Courant Couple éclairement/ faciès de courant Combinaison des deux facteurs éclairement et faciès de courant (lotique/lentique), en fonction de leurs typologies respectives. (utilisé pour l’IBMR) Profond Courant Couple profondeur/ faciès de courant Combinaison des deux facteurs profondeur et faciès de courant (lotique/lentique), en fonction de leurs typologies respectives. (utilisé pour l’IBMR) Strat ripisylve Stratification de la ripisylve La liste des classes de faciès de stratification de la ripisylve est définie dans la nomenclature n°579. Cont ripisylve Continuité longitudinale de la ripisylve La liste des classes de faciès de continuité longitudinale de la ripisylve est définie dans la nomenclature n°582. Comp berges Composition des berges La liste des classes de faciès de composition des berges est définie dans la nomenclature n°578. Ep ripisylve Epaisseur de la ripisylve La liste des classes de faciès d'épaisseur de la ripisylve est définie dans la nomenclature n°583. Comp ripisylve Composition de la ripisylve La liste des classes de faciès de composition de la ripisylve est définie dans la nomenclature n°581. Faciès de vitesse Vitesses moyennes d’écoulement de l’eau observées, selon une typologie prédéfinie. La typologie est définie dans la nomenclature n°278. Inconnu Inconnu < 0,05 m/s Vitesse < 0,05 m/s Macrophytes 0,05-0,2 entre 0,05 et 0,2 m/s Macrophytes 0,2- 0,5 entre 0,2 et 0,5 m/s Macrophytes 0,5 -1 m/s entre 0,5 et1 m/s Macrophytes >1 >1 m/s Macrophytes < 5 Vitesse < 5 cm/s Invertébrés, Diatomées, Oligochètes >= 150 Vitesse >= 150 cm/s Invertébrés, Diatomées, Oligochètes 5 - 25 5 cm/s <= vitesse < 25 cm/s Invertébrés, Diatomées, Oligochètes 75 -150 75 cm/s <= vitesse < 150 cm/s Invertébrés, Diatomées, Oligochètes 25-75 25 cm/s <= vitesse < 75 cm/s Invertébrés, Diatomées, Oligochètes >=75 Vitesse >=75 cm/s Invertébrés. Ce code correspondait à la méthode Ref (même s'il n'a, à ma connaissance, finalement pas été utilisé pour celle-ci), la méthode RCS ignorant pour l'instant plus simplement les secteurs de vitesse >150cm/s comme l'indique son tableau III et son annexe II < 10 Vitesse < 10 cm/s Invertébrés 10 - 25 10 cm/s <= vitesse < 25 cm/s Invertébrés 25-50 25 cm/s <= vitesse < 50 cm/s Invertébrés 50-100 50 cm/s <= vitesse < 100 cm/s Invertébrés 100-200 100 cm/s <= vitesse < 200 cm/s Invertébrés >200 Vitesse >= 200 cm/s Invertébrés Faciès morphodynamique Parties de cours d’eau présentant des caractéristiques relativement homogènes de vitesse, granulométrie, profondeur, profil en travers… La liste des valeurs possibles est définie dans la nomenclature n°53. (Document de référence : « Malavoi J.R. & Souchon Y. », 2002 - Description standardisée des principaux faciès d’écoulement observable en rivière Note technique - Bulletin Français de Pêche et de Pisciculture, 365/366 : 357-372.) Remarque : Le document de référence cité précédemment donnait les valeurs de 60cm et 30cm/s comme limites respectives entre faible et forte profondeur et faible et forte vitesse. Ces valeurs n’ont pas été reprises dans l’annexe du protocole macroinvertébrés RCS qui préconise une appréciation en relation avec la taille du cours d’eau. inconnu Faciès morphodynamique inconnu Ch. Lotique Chenal lotique Ecoulement lotique profond, à profil symétrique, profil en long pas de situation particulière Ch. Lentique Chenal lentique Ecoulement lentique profond, à profil symétrique, profil en long souvent en amont d'un obstacle ou d'un faciès de type radier ou rapide. Bordure Zone de bordure A réserver aux zones littorales d'une largeur significative et de caractéristiques de courant, de granulométrie et/ou de profondeur différentes du reste du lit (ne pas doubler avec encoche de bordure) morte Eau morte ou lône Partie en eau plus ou moins déconnectée (souvent connectée par l'aval seulement) du lit principal. Courant Courant Données historiques Plat lent. Plat lentique Anciennement désigné par « Plat ».: écoulement lentique peu profond , à profil symétrique, profil en long souvent en amont d’un obstacle ou d’un faciès de type radier ou rapide. Mouille Type Mouille Grand Type qui comprend les codes de faciès morphodynamique 2, 19, 18, 20 et 1. Plat courant Plat courant Ecoulement lotique peu profond, à profil symétrique, profil en long pente douce, écoulement uniforme,vaguelettes à la surface de l’eau liées à la présence du substrat à proximité de la surface libre. Rugosité relative H/S50 ~ 3 à 4 (H = hauteur d’eau, S50 = petit axe du D50, diamètre médian du substrat Radier Radier Ecoulement lotique peu profond, à profil symétrique, profil en long pente plus forte, rupture de pente plus nette avec les faciès limitrophes.Turbulence plus forte liée à l’affleurement du substrat au ras de la surface libre. Rugosité relative H/S50 ~ 2 à 3 Rapide Rapide Ecoulement lotique peu profond, à profil symétrique, profil en long faciès à forte pente et forte turbulence matérialisée par de l'écume blanche 1,2<H/S50<2 Escalier Escalier Faciès intermédiaire entre Rapide et Cascade+Fosse de dissipation, caractérisé par des rides transversales de blocs (perpendiculaires à l'écoulement) de 20 à 40cm de hauteur, espacés régulièrement de 1 à plusieurs mètres. Cascade Cascade Ecoulement lotique peu profond, à profil symétrique, profil en long dénivelé de 0,5 à 1,5m. Souvent associé à une fosse de dissipation Chute Chute Ecoulement lotique peu profond, à profil symétrique, profil en long dénivelé > 1,5 m. Souvent associé à une fosse de dissipation lentique indeterm Faciès lentique indéterminable Réservé au cas où il n'est pas possible de se prononcer (accès non possible à la zone et fonds non visibles). Qualification selon la seule vitesse de courant superficielle lotique indéterm Faciès lotique indéterminable Réservé au cas où il n'est pas possible de se prononcer (accès non possible à la zone et fonds non visibles). Qualification selon la seule vitesse de courant superficielle. Anciennement désigné par « Courant » dans la liste des faciès morphodynamiques du SANDRE. - Chenal lotique : Ecoulement lotique de profondeur >60cm Banc de convexi Banc de convexité Atterrissement situé dans la partie interne d'un méandre. Partage généralement le profil en travers du cours d'eau avec un mouille de concavité. A n'utiliser que si une partie du banc est immergée. Mouille de concavi Mouille de concavité Ecoulement lentique profond, à profil asymétrique, profil en long Mouille (h>60cm) située dans la concavité d'un méandre. Partage généralement le profil en travers du cours d'eau avec un banc de convexité (immergé ou non) Fosse de dissipation Fosse de dissipation Ecoulement lentique profond, à profil symétrique, profil en long Fosse (h>60cm) située immédiatement à l'aval d'une cascade ou d'une chute. Fosse d’affouillement Fosse d’affouillement Ecoulement lentique profond, à profil asymétrique, profil en long Creusement (h>60cm) le long d'un obstacle à l'écoulement (embacles, rochers, piles de pont…) Sous-berge Sous-berge Zone située sous un surplomb de la berge ou de racines denses Encoche Encoche de bordure Encoche en berge de caractéristiques de courant, de granulométrie et/ou de profondeur différentes du reste du lit. Radier/Rapide Type radier / rapide Grand Type qui comprend les codes de faciès morphodynamique 9, 10, 12 et 13. Faciès de courant « Faciès lentique : partie de cours d’eau présentant une faible vitesse de courant. Faciès lotique : partie de courant présentant une forte vitesse de courant [tiré de la norme IBMR NF T90-395 octobre 2003]. Les diatomistes ont subdivisé ces deux classes. La liste des valeurs possibles est définie dans la nomenclature n°54. inconnu Classe de courant inconnue Lotique Lotique Semi-lot + semi lent. Semi-lotique + semi lentique Marée montante Marée montante Marée descendante Marée descendante Etal Etal Aucun courant Aucun courant (pas d'écoulement) Semi-lotique Semi-lotique Semi-lentique Semi-lentique Lentique Lentique Lotique + lentique Lotique + lentique Lot.+semi-lot Lotique+semi-lotique Lot. + semi-lent. Lotique + semi-lentique Lent.+semi-lot Lentique+semi-lotique Lent + semi-lenti Lentique + semi-lentique Lotique Lotique Lentique Lentique Faciès de profondeur Profondeurs d’eau observées, correspondant à la hauteur entre la surface de l'eau et le fond du cours d'eau ou plan d’eau, selon une typologie prédéfinie. cf nomenclature n°450. Inconnu Inconnu < 0,1 <0,1 m 0,1 - 0,5 Entre 0,1 et 0,5 m 0,5 -1 Entre 0,5 et 1 m 1-2 m Entre 1 et 2 m >2 >2 m <=1m <=1 m 2 - 4 Entre 2 et 4 m 4 - 8 Entre 4 et 8 m 8 - 16 Entre 8 et 16 m > 16 >16 m Faciès d'éclairement Intensités d'éclairement observées selon une typologie prédéfinie. Cf nomenclature n°500. Très ombragé Très ombragé Ombragé Ombragé Peu ombragé Peu ombragé Eclairé Eclairé Très éclairé Très éclairé Faciès de rive Le faciès de rives se rapporte à une typologie de description d’un plan d’eau (typologie de rives des unités d'observation) définie dans la méthodologie d'étude des communautés de macrophytes en plans d'eau (Novembre 2007, CEMAGREF). Cette classification se base sur la combinaison de deux critères: - le premier critère est une description des formations végétales et/ou des aménagements de rives. Il existe quatre modalités possibles. - le second critère correspond à la largeur de la zone littorale euphotique: Le type 'a' correspond à une largeur de la zone littorale euphotique importante, supérieure à 50m Le type 'b' correspond à une largeur de la zone littorale euphotique réduite, inférieure à 50m Il existe en tout huit modalités possibles de rives. La liste est définie dans la nomenclature n°536. 1a Zones humides rivulaires caractéristiques - Largeur de la zone littorale euphotique importante 1b Zones humides rivulaires caractéristiques - Largeur de la zone littorale euphotique réduite 2a Zones rivulaires colonisées par la végétation arbustive et arborescente non humide - Largeur de la zone littorale euphotique importante 2b Zones rivulaires colonisées par la végétation arbustive et arborescente non humide - Largeur de la zone littorale euphotique réduite 3a Zones rivulaires non colonisées par la végétation arbustive et arborescente non humide - Largeur de la zone littorale euphotique importante 3b Zones rivulaires non colonisées par la végétation arbustive et arborescente non humide - Largeur de la zone littorale euphotique réduite 4a Zones artificielles ou subissant des pressions anthropiques visibles - Largeur de la zone littorale euphotique importante 4b Zones artificielles ou subissant des pressions anthropiques visibles - Largeur de la zone littorale euphotique réduite Pourcentage de recouvrement Le pourcentage de recouvrement est le résultat associé à chaque zone de faciès. C’est un nombre compris entre 0 et 100 indiquant la surface ou le volume couvert par une occurrence de zone de faciès se rapportant à une variable physique donnée (substrat, couple substrat/vitesse, éclairement,…), observée généralement sur un point de prélèvement au cours d’une opération de prélèvement biologique, à l’exception des résultats de recouvrement de chaque classe de rives recueillis dans le cadre de la méthodologie d'étude des communautés de macrophytes en plans d'eau (Novembre 2007, CEMAGREF), qui expriment quant à eux la représentativité d’un type de rive à l’échelle du plan d’eau et non pas à l’échelle d’un point de prélèvement. Dès lors qu’un type de zones de faciès est décrit, la somme des pourcentages de recouvrement associés à chaque occurrence de zone de faciès, conformément à la typologie de zones de faciès en question, DOIT être égale à « 100 » (pas de double compte en cas de couches multiples, mélanges etc…). ATTENTION ! A NE PAS CONFONDRE POURCENTAGE DE RECOUVREMENT POUR CHAQUE OCCURRENCE DE ZONE DE FACIES AVEC LE POURCENTAGE DE RECOUVREMENT DE TAXONS POUR LES MACROPHYTES. Présence ou absence de la zone de faciès Certaines méthodes biologiques demandent uniquement à relever la présence ou l’absence d’occurrences de zones de faciès. Les valeurs possibles prises par l’attribut « Présence/Absence de zones de faciès » sont définies dans la nomenclature n°542. Absence Présence Inconnu Code du substrat Le code du substrat est un identifiant définissant le substrat prelevé ou présent sur une zone lors d'un prélèvement biologique. La liste des substrats est définie dans la nomenclature n°274. Certains codes sont signifiants, la lettre présente dans le code indiquant la catégorie d'organismes vivants recherchés sur les substrats, en rapport avec le protocole suivi: D[X]: Diatomées M[X]: Macrophytes O[X]: Oligochètes S[X]: Invertébrés Inconnu Substrat inconnu Invertébrés Bryophytes Bryophytes Diatomées Hydrophytes Hydrophytes Diatomées Litières Litières Diatomées branchages, racines branchages, racines Diatomées pierres pierres, galets ]64-256 mm] Diatomées graviers graviers ]2,5-16 mm] Diatomées Hélophytes Hélophytes Diatomées Sédiments fins, vases Sédiments fins, vases Diatomées Sables, limons Sables, limons [0,1 - 2,5 mm] Diatomées roches, dalles, blocs roches, dalles, blocs Diatomées Algues Algues Diatomées marne et argile marne et argile Diatomées Cailloux Cailloux ]16 - 64 mm] Diatomées Métal Métal Diatomées Béton hors piles pont Béton hors piles de pont Diatomées Verre Verre Diatomées Briques Briques Diatomées Tuiles Tuiles Diatomées Piles de pont Piles de pont Diatomées Palplanches hors bois Palplanches hors bois Diatomées Autres mat.artificiels Autres mat.artificiels Diatomées CAILPIERGALET Cailloux, pierre, galet ]16 - 256mm] Diatomées Vases Vases Macrophytes Terre, argile, marne Terre, argile, marne Macrophytes Sables, Graviers, Sables, Graviers, Macrophytes Cailloux, Cailloux, pierres, galets, Macrophytes Blocs, dalles Blocs, dalles Macrophytes Débris organiques Débris organiques Macrophytes Artificiel Artificiel Macrophytes Racines, branch Racines, branchages Limons Limons Oligochètes Sables Sables Oligochètes Graviers Graviers (2,5 < < 25 mm) Oligochètes Galets, pierre Galets, pierre (25mm - 250mm) Oligochètes Petits blocs Petits blocs (250mm - 600mm) Oligochètes Gros blocs Gros blocs ( > 600mm) Oligochètes Sédiment fin composite Sédiment fin composite Oligochètes Bryophytes Bryophytes Invertébrés Hydrophytes Spermaphytes ou phanérogames immergés Invertébrés Litières Litières Invertébrés Branchages Branchages Invertébrés Racines Racines Invertébrés Troncs Troncs Invertébrés Pierres Pierres (blocs anguleux, 25 mm < Ø < 250 mm) Invertébrés Galets Galets (blocs roulés, 25 mm < Ø < 250 mm) Invertébrés Granulats Granulats grossiers (2,5 mm < Ø < 25 mm) Invertébrés Hélophytes Spermaphytes ou phanérogames émergents Invertébrés Vases Sédiments fins ± organiques ("vases" =< 0,1 mm) Invertébrés Sables Sables (strictement minéral, Ø =< 2,5 mm) Invertébrés Limons Limons (minéral et organique, Ø =< 2,5 mm) Invertébrés Roches Roches (substrats immergés avec protubérances, Ø > 250 mm) Invertébrés Dalles Dalles (substrats immergés sans protubérances, Ø > 250 mm) Invertébrés Sols Sols (surfaces artificielles horizontales, Ø > 250 mm) Invertébrés Parois Parois (surfaces artificielles verticales, Ø > 250 mm) Invertébrés Algues Algues Invertébrés Argiles Marnes et argiles Invertébrés Bactéries Bactéries Invertébrés Champignons Champignons Invertébrés Cailloux Cailloux Invertébrés Elts. organiques Eléments organiques grossiers (litières, branchages, racines) Invertébrés Pierres, galets Sédiments minéraux de grande taille (pierres, galets) 25 mm < Ø < 250 mm Invertébrés Sables, limons Sables et limons Invertébrés Roches, dalles Surfaces naturelles et artificielles (roches, dalles, sols, parois) blocs Ø > 250 mm Invertébrés Algues, argiles Algues, marne ou argile Invertébrés Branch, racines Branchage et racines Invertébrés Dalles, argiles Surfaces uniformes dures naturelles et artificielles (roches, dalles, marnes et argiles compactes) Invertébrés Blocs Blocs (>250 mm) inclus dans une matrice d'éléments min??raux de grande taille (25 ?? 250 mm) Invertébr??s non-déterminé Substrat non-déterminé Différent de 0 (inconnu) puisque inconnu peut laisser supposer que le bancarisateur n'a pas obtenu l'information alors que non-déterminé concerne le préleveur (exemple en cas de trouble important de l'eau). artificiel Substrat artificiel Substrat, mis en place par l'opérateur, constitué par un mélange de pierres et de corde enfermé dans un grillage en plastique. différent du substrat "artificiel (M7) pour les Mphytes" Eau Eau Phytoplancton, Zooplancton DALLES Dalles (dont dalles d'argile) >1024 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth ROCHERS Rochers >1024 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth BLOCS Blocs 256 - 1024 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth PIER GROS Pierres Grossières 128 - 256 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth PIER FIN Pierres Fines 64 - 128 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth CAIL GROS Cailloux Grossiers 32 - 64 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth CAIL FIN Cailloux Fins 16 - 32 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth GRAV GROS Graviers Grossiers 8 -16 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth GRAV FIN Gravier fins 2 - 8 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth SABLE Sables 0,625 - 2 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth LIMON Limons 0,0039 - 0,0625 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth ARGILE Argiles diamètre < 0,0039 mm; catégorie provenant de l'échelle granulométrique de Wentwoth CHEVELU Chevelu racinaire VEGET PLOMB Végétation surplombante DEBRIS LIGNEUX Débris ligneux grossiers / Embâcle VEG AQUAT Végétation aquatique POOL DETR Pool détritique Accumulation de matière organique particulaire grossière (feuilles mortes, écorce, autres débrits végétaux) CONC CALC Concrétion calcaire Libellé du substrat Le libellé du substrat est un texte court décrivant le substrat. Code du stade de développement Code de valeur possible attribué à chaque état morphologique dépendant de l’âge du taxon, selon la nomenclature n°497. Stade inconnu Stade inconnu Stade indéterminé Stade indéterminé Stade indéterminé Oeuf Oeuf Individu en cours de développement embryonnaire. Stade larvaire Stade larvaire Succession de stades de développement par mue (variable selon les espèces : par exemple 5 à 27 mues chez Baetis) avant la nymphose ou directement le stade adulte. Stade nymphal Stade nymphal Stade de métamorphose, appelé parfois chrysalide. Stade adulte Stade adulte Stade appelé aussi Imago, correspondant à la maturité sexuelle. Tout stade Tout stade de développement confondu Mnémonique du stade de développement Le mnémonique est l'appellation synthétique attribuée à chaque état morphologique. Libellé du stade de développement Le libellé est l'appellation explicite attribuée à chaque état morphologique. Définition du stade de développement La définition vise à expliciter chaque état morphologique dépendant de l’âge du taxon. Date de la mesure de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique La date de la mesure de la condition environnementale des prélèvements biologiques est la date au jour près à laquelle a débuté la mesure de la condition environnementale. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Heure de la mesure de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique L'heure de la mesure de la condition environnementale d'un prélèvement biologique est l'heure à laquelle a débuté la mesure de la condition environnementale. L'heure est arrondie à la minute la plus proche. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Mesure de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique La mesure de la condition environnementale d'un prélèvement biologique est soit la valeur du résultat du paramètre quantitatif, soit le code de la valeur possible du paramètre qualitatif. Le résultat du paramètre quantitatif est exprimé dans l'unité de mesure définie pour le paramètre mesuré avec 5 chiffres significatifs au maximum. Cette information est établie par le préleveur, sous la responsabilité du ou des organismes producteurs de cette donnée. Commentaires sur la mesure de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique Les commentaires sur les mesures des conditions environnementales de prélèvements biologiques comportent toutes les remarques éventuelles de l'organisme à propos de la mesure qu'il a effectuée. Qualification de la condition environnementale du prélèvement élémentaire biologique Compte-tenu que les conditions environnementales peuvent être des paramètres assez généraux plus ou moins indépendants des résultats de l'opération de prélèvement proprement dite (description des zones de faciès, composition des listes faunistiques, résultats biologiques), le processus de validation des mesures environnementales par le producteur de données est distinct de celui propre aux résultats de l’opération de prélèvement biologique. Ceci est valable pour les conditions environnementales liées à l’opération de prélèvement mais aussi à celles liées à chaque prélèvement élémentaire. La validation des mesures environementales s’appuie également sur les deux attributs « Statut » et « Qualification » citées précédemment. La qualification de la donnée indique le niveau de la qualité de la donnée selon les valeurs définies dans la nomenclature n°414. Cette donnée est renseignée par le producteur. Par exemple, pour différencier une donnée « validée par un processus automatisée » d’une donnée « validée par un expert », il n’est pas créé deux niveaux de validation. Au contraire, dans les deux cas, la donnée est qualifiée « Correcte » mais elle est accompagnée d’une information complémentaire, le statut de la donnée, qui indique l’état d’avancement de cette validation : dans le premier cas, on indique le couple (CORRECTE, CONTROLE AUTOMATIQUE). Dans le second, il s’agit du couple (CORRECTE, EXPERT). Toute validation est toujours indiquée par ce couple. non définissable Qualification non définissable Une valeur sera non définissable lorsque le producteur est dans l'impossibilité d'obtenir les informations nécessaires pour évaluer la conformité de la donnée. Il s'agit par exemple de données historiques récupérées des archives dont on a perdu toute information sur la façon dont elles ont été produites. Correcte Correcte Une valeur est déclarée « Correcte » lorsque elle est estimée valide au stade de validation indiquée dans l'information « statut de la donnée » et vis-à-vis de la finalité recherchée. Incorrecte Incorrecte Une valeur est déclarée « Incorrecte » lorsque elle est estimée erronée au stade de validation indiqué dans l'information « statut de la donnée » et vis-à-vis de la finalité recherchée. Incertaine Incertaine Une valeur sera déclarée « Incertaine » si la validité de la donnée reste « douteuse » au stade de validation indiquée dans l'information « statut de la donnée ». Dans la mesure du possible, la qualification « Douteuse » doit être une étape transitoire de la validation de la donnée et doit être réservé à des avancements intermédiaires de la validation. Non qualifié Non qualifié Etat initial de la mesure qui n'a encore subi aucun audit ou interprétation du producteur de données en vue de sa validation. Statut de la mesure environnementale du prélèvement élémentaire biologique Compte-tenu que les conditions environnementales peuvent être des paramètres assez généraux plus ou moins indépendants des résultats de l'opération de prélèvement proprement dite (description des zones de faciès, composition des listes faunistiques, résultats biologiques), le processus de validation des mesures environnementales par le producteur de données est distinct de celui propre aux résultats de l’opération de prélèvement biologique. Ceci est valable pour les conditions environnementales liées à l’opération de prélèvement mais aussi à celles liées à chaque prélèvement élémentaire. La validation des mesures environementales s’appuie également sur les deux attributs « Statut » et « Qualification » citées précédemment. Le statut de la donnée indique ensuite l’état d’avancement de la validation des données selon les valeurs définies dans la nomenclature n°446. Donnée brute Donnée brute Données issues du processus d¿acquisition n¿ayant subi aucun examen. Ex. : donnée directement issue de l¿appareil de mesure Niveau 1 Donnée contrôlée niveau 1 (données contrôlées) Le producteur examine les résultats par rapport à la connaissance qu¿il a sur la station et le point de prélèvement. Exemple : comparaison par rapport à des seuils min-max classiquement rencontrés sur le point, utilise un système expert qui compare les résultats entre eux. Niveau 2 Donnée contrôlée niveau 2 (données validées) Le producteur regarde et vérifie l¿ensemble de la chaîne d¿acquisition et la cohérence des données (par exemple : depuis le prélèvement, conditionnement, flaconnage, transport, mesure en laboratoire). Donnée interprétée Donnée interprétée La valeur a été utilisée dans un rapport ou valorisée. Cette mise en perspective de l¿information permet de consolider son niveau de validité et détecter les dernières erreurs. Par exemple : diagrammes binaires, comparaison faciès, etc¿. Code remarque sur le résultat de liste faunistique Quel que soit le type de résultat (dénombrement absolu, recouvrement, densité d’un taxon ou caractère « Présence » « Absence »), un résultat élémentaire de liste faunistique ou floristique est obligatoirement accompagné d’un code remarque, information complémentaire relative à l’interprétation du résultat proprement dit. Le code remarque prend l’une des valeurs définies dans la nomenclature n°155. Analyse non faite Analyse non faite L'analyse n'a pu être faite. Le résultat doit alors être vide mais le code remarque indiquer "0" Domaine de validité Résultat > seuil de quantification et < au seuil de saturation ou Résultat = 0 Quand les concentrations mesurées se situent dans la gamme de validité de la méthode utilisée (résultat > seuil de quantification et < au seuil de saturation), le résultat prend la valeur trouvée (même s'il est égal à zéro) et le code remarque la valeur "1". En microbiologie ou en hydrobiologie, le code remarque "1" accompagne un résultat de type dénombrement ou recouvrement estimé ou mesuré d’un taxon. < seuil de détection Résultat < seuil de détection Quand la méthode de mesure n'est pas assez performante pour mesurer la concentration de la substance recherchée, le résultat prend alors la valeur du seuil de détection ou du seuil de quantification suivant qu'il est inférieur à l'un de ces deux seuils. Parallèlement, le code remarque prend les valeurs 2 ou 7. > seuil de saturation Résultat > seuil de saturation Quand la concentration de la substance recherchée est trop élevée pour la méthode utilisée, le résultat donne alors la valeur du seuil de saturation et le code remarque prend la valeur 3. Présence ou Absence Présence ou Absence Les codes remarques 'Présence' et 'Absence' (4) se rapportent essentiellement à la microbiologie où il est seulement nécessaire de détecter la présence ou l'absence de micro-organismes sans qu'il ne faille les dénombrer même si cela est faisable. Le résultat doit prendre pour valeur "1" pour "Présence" et "2" pour absence. Incomptable Incomptable De même, le code 'Incomptable' (5) fait référence aux analyses microbiologiques qui ne permettent pas d'établir ni le nombre de micro-organismes ni la valeur du seuil que dépasse le nombre. Il s'agit, par exemple, des analyses dont la boîte de Pétri est totalement saturée. Taxons non individualis. Taxons non individualisables Le code remarque « 6 » est utilisé en microbiologie ou en hydrobiologie, lorsque l’objet de l’analyse est bien un dénombrement absolu, mais dont le résultat n’a pu être déterminé car les individus ne sont pas différenciables Traces Traces (< seuil de quantification et > seuil de détection) Quand la méthode de mesure n'est pas assez performante pour mesurer la concentration de la substance recherchée, le résultat prend alors la valeur du seuil de détection ou du seuil de quantification suivant qu'il est inférieur à l'un de ces deux seuils. Parallèlement, le code remarque prend les valeurs 2 ou 7. Dénombrement > Valeur Dénombrement > Valeur Code remarque utilisé en microbiologie ou hydrobiologie pour désigner un dénombrement de taxon supérieur à une valeur, la valeur en question étant mentionnée dans l'attribut résultat. Dénombrement < Valeur Dénombrement < Valeur Code remarque utilisé en microbiologie ou hydrobiologie pour désigner un dénombrement de taxon inférieur à une valeur, la valeur en question étant mentionnée dans l'attribut résultat. < seuil de quantification Résultat < au seuil de quantification Si la méthode de mesure n'est pas assez performante et si le résultat de mesure s'avère être en dessous du seuil de quantification, le code remarque prend alors la valeur 10. Le résultat quant à lui prend la valeur du seuil de quantification. Echelle Absente Echelle Absente Code remarque utilisé pour le paramètre cote à l'échelle (code sandre paramètre [1429]) et indiquant que la lecture n'a pu être réalisée en raison de l'absence d'échelle. Le résultat de l'analyse doit être vide et le code remarque doit être [11]. Echelle non exploitable Echelle non exploitable Code remarque utilisé pour le paramètre cote à l'échelle (code sandre paramètre [1429]) et indiquant que la lecture n'a pu être réalisée car l'échelle est présente mais elle n'est pas exploitable (cassée, illisible, ...). Le résultat de l'analyse doit être vide et le code remarque doit être [12]. Dénombrement de taxon Le résultat de tout dénombrement absolu d’un taxon est porté par l’attribut « Dénombrement abolu de taxon ». Le dénombrement absolu d’un taxon correspond généralement à une quantification du nombre d'individus appartenant à un taxon donné, présents sur le ou les substrats extraits du milieu au cours d’un ou plusieurs prélèvements élémentaires. Au sein d’une liste en dénombrement absolu, certains taxons peuvent faire l’objet d’exception : individus non différenciables par exemple ou individus proliférants quantifiés comme supérieurs à une valeur. Voir tableau des codes remarques ci-après. Pour le support « PHYTOPLANCTON », un dénombrement absolu associé à un taxon donné correspond à une quantification du nombre de cellules observés, que ces cellules soient individualisées ou bien agglomérées sous forme de colonies ou de filaments. Pour le support « DIATOMEES », le terme d'abondance est souvent utilisé pour désigner le dénombrement absolu de taxon. Attention à ne pas confondre avec l’abondance relative (pourcentage d’individus / total d’individus) ou la densité (valeur ramenée à une unité de volume ou de surface). Un dénombrement associé à un taxon d'un niveau donné (genre, espèce,…), exclut tous les individus ayant été déterminés à un niveau inférieur. Ce dénombrement correspond alors au nombre d'individus n'ayant pu être identifié à un niveau inférieur. Un dénombrement associé à un taxon de niveau « Genre » exclut tous les individus ayant été déterminés au niveau « espèce » du genre en question. Ce dénombrement correspond alors à l’ensemble des individus dont l’espèce est indéterminée. Attention, afin d’éviter tout double compte, l’interprétation d’un résultat de dénombrement diffère selon le niveau taxonomique du taxon associé à ce résultat. Un résultat d’identification (présence ou absence) de taxon, sans dénombrement des individus correspondants, est obligatoirement accompagné d’un code remarque égal à la valeur « 4 » (Présence ou absence). Le résultat d’une identification du caractère « Présence » ou « Absence » d’un taxon au sein d’une liste faunistique ou floristique est porté par l’attribut « Dénombrement de taxon ». Les valeurs possibles sont les suivantes : Code Libellés 1 Présence 2 Absence Pourcentage de recouvrement du taxon Pour le support biologique « MACROPHYTES », le résultat associé à chaque taxon d’une liste floristique correspond à un pourcentage de recouvrement de l’ensemble des individus appartenant à ce même taxon, par rapport à la surface de référence du point de prélèvement. Il s’agît d’un nombre compris entre 0 et 100 indiquant la surface couverte par le taxon végétal concerné et déterminé selon les préconisatons de la méthode appliquée (prise en compte ou non des doubles couches, des mélanges etc…). Le pourcentage de recouvrement d’un taxon DOIT être au maximum égal à 100, la somme des pourcentages de recouvrement de chaque taxon végétal d’une liste floristique PEUT être inférieure à 100 (recouvrement végétal du point de prélèvement incomplet) ou supérieure à 100 (cas d’un peuplement pluristratifié). Remarque particulière relative aux résultats des indices d’abondance macrophytique : La méthode d’étude des communautés de macrophytes en plans d’eau (Novembre 2007, CEMAGREF ; code Sandre 642) exige l’utilisation d’un indice d’abondance taxonomique (prenant une valeur entière comprise entre 1 et 5 inclue) pour les relevés floristiques effectués sur les différents transects (zone littorale et et des profils perpendiculaires à la rive). Par souci d’harmonisation des résultats de listes floristiques se rapportant au support « MACROPHYTES », les valeurs de cet indice d’abondance sont ramenées à des valeurs de pourcentage, telles que mentionnées dans le tableau suivant : Degré de confiance sur la détermination du taxon Le degré de confiance sur la détermination d’un taxon donné précise si le déterminateur considère que l’identification du taxon est fiable (degré fort) ou au contraire plus incertaine (degré faible). Le degré de confiance porte uniquement sur l’identification du taxon et non sur la valeur du dénombrement ou du recouvrement obtenue. Il est donc possible, au sein d’une liste, qu’un même taxon soit présent plusieurs fois, les différents individus n’ayant pas tous été déterminés avec le même degré de confiance : exemple : 2 individus adultes déterminés avec un degré de confiance fort d’une part et 3 larvules déterminées avec un degré de confiance faible d’autre part. La liste des valeurs administrée par le SANDRE est définie dans la nomenclature n°499. Faible Faible Fort Fort Inconnu Inconnu Densité par taxon La densité d’un taxon est le dénombrement absolu associé à un taxon donné ramené à une unité de volume ou de surface, selon le support biologique étudié et la méthode biologique appliquée à l’opération de prélèvement. Pour le support PHYTOPLANCTON, la densité d’un taxon est exprimée en nombre de cellules par millilitre (n/mL), que ces cellules soient bien individualisées ou agglomérées sous forme de colonie ou de filaments. Pour les données Oligochètes et Mollusques, la densité d’un taxon est exprimée en Nombre d'individus par surface de 0,1 m2 (n/(0,1m2). Taxon pris en compte dans le calcul de l'indice Information obligatoire selon la norme IBD, mais dont le contenu n’est actuellement toujours pas entièrement clair malgré la mise à jour de cette norme : vise-t-elle les taxons simplement cités dans la norme (et synonymes éventuels) comme le fait le logiciel Omnidia ou bien (plus intéressant pour l’interprétation) vise-t-elle les taxons cités dans la norme et présents dans l’échantillon à un effectif entraînant réellement leur prise en compte dans le calcul. La codification de cette information prend donc en compte les différents cas. Cet attribut est purement indicatif et son contenu découle de façon automatique des opérations de calcul de l'indice. Il ne peut aucunement servir pour l'utilisateur à exclure volontairement du champ de calcul de l'indice, des taxons lors de leur saisie. Cf nomenclature n°478. Inconnu Inconnu Cité norme calcul inconnu Cité dans la norme, prise en compte dans le calcul inconnue Cité norme eff insuff Cité dans la norme mais effectif insuffisant pour prise en compte dans le calcul Cité norme eff suff Cité dans la norme et effectif suffisant pour prise en compte dans le calcul Accréditation du résultat biologique L'accréditation d'une analyse indique, à l'aide de l'un des codes suivants, le degré de confiance porté sur la qualité et la fiabilité du résultat. Cette donnée est renseignée par le déterminateur. Cf nomenclature n°299. ACCREDITE Analyse réalisée sous accréditation Analyse réalisée par un laboratoire officiellement accrédité pour cette tâche par le Comité Français d'Accréditation (COFRAC) ou un autre organisme d’accréditation similaire, en respectant notamment les spécifications de la norme ISO 17025. L’analyse est fournie sous logo de l’organisme accréditeur NON ACCREDITE Analyse réalisée hors accréditation Analyse réalisée par un intervenant n'étant pas accrédité pour le paramètre considéré ou analyse réalisée par un intervenant accrédité mais considérant que les conditions de réalisation de l’analyse ne permettent pas la fourniture du résultat sous logo de l’organisme accréditeur. INCONNU Inconnu Analyse réalisée dans des conditions d'accréditation inconnues Résultat biologique Valeur numérique du résultat biologique. Code remarque sur le résultat biologique Le code remarque associé à un résultat biologique permet d'apporter des précisions sur le résultat en indiquant si le résultat obtenu est inférieur ou supérieur à une certaine valeur. Les résultats de paramètres qualitatifs tels que les indices biologiques sont généralement inclus dans leur domaine de validité respectif (code remarque égal à 1). Certains résultats se rapportant à des paramètres biologiques complémentaires, de type quantitatif, peuvent être supérieur ou inférieur à une certaine valeur, auquel cas les codes remarque 8 et 9 sont à utiliser. La liste des valeurs possibles est définie dans la nomenclature n°155. Analyse non faite Analyse non faite L'analyse n'a pu être faite. Le résultat doit alors être vide mais le code remarque indiquer "0" Domaine de validité Résultat > seuil de quantification et < au seuil de saturation ou Résultat = 0 Quand les concentrations mesurées se situent dans la gamme de validité de la méthode utilisée (résultat > seuil de quantification et < au seuil de saturation), le résultat prend la valeur trouvée (même s'il est égal à zéro) et le code remarque la valeur "1". En microbiologie ou en hydrobiologie, le code remarque "1" accompagne un résultat de type dénombrement ou recouvrement estimé ou mesuré d’un taxon. < seuil de détection Résultat < seuil de détection Quand la méthode de mesure n'est pas assez performante pour mesurer la concentration de la substance recherchée, le résultat prend alors la valeur du seuil de détection ou du seuil de quantification suivant qu'il est inférieur à l'un de ces deux seuils. Parallèlement, le code remarque prend les valeurs 2 ou 7. > seuil de saturation Résultat > seuil de saturation Quand la concentration de la substance recherchée est trop élevée pour la méthode utilisée, le résultat donne alors la valeur du seuil de saturation et le code remarque prend la valeur 3. Présence ou Absence Présence ou Absence Les codes remarques 'Présence' et 'Absence' (4) se rapportent essentiellement à la microbiologie où il est seulement nécessaire de détecter la présence ou l'absence de micro-organismes sans qu'il ne faille les dénombrer même si cela est faisable. Le résultat doit prendre pour valeur "1" pour "Présence" et "2" pour absence. Incomptable Incomptable De même, le code 'Incomptable' (5) fait référence aux analyses microbiologiques qui ne permettent pas d'établir ni le nombre de micro-organismes ni la valeur du seuil que dépasse le nombre. Il s'agit, par exemple, des analyses dont la boîte de Pétri est totalement saturée. Taxons non individualis. Taxons non individualisables Le code remarque « 6 » est utilisé en microbiologie ou en hydrobiologie, lorsque l’objet de l’analyse est bien un dénombrement absolu, mais dont le résultat n’a pu être déterminé car les individus ne sont pas différenciables Traces Traces (< seuil de quantification et > seuil de détection) Quand la méthode de mesure n'est pas assez performante pour mesurer la concentration de la substance recherchée, le résultat prend alors la valeur du seuil de détection ou du seuil de quantification suivant qu'il est inférieur à l'un de ces deux seuils. Parallèlement, le code remarque prend les valeurs 2 ou 7. Dénombrement > Valeur Dénombrement > Valeur Code remarque utilisé en microbiologie ou hydrobiologie pour désigner un dénombrement de taxon supérieur à une valeur, la valeur en question étant mentionnée dans l'attribut résultat. Dénombrement < Valeur Dénombrement < Valeur Code remarque utilisé en microbiologie ou hydrobiologie pour désigner un dénombrement de taxon inférieur à une valeur, la valeur en question étant mentionnée dans l'attribut résultat. < seuil de quantification Résultat < au seuil de quantification Si la méthode de mesure n'est pas assez performante et si le résultat de mesure s'avère être en dessous du seuil de quantification, le code remarque prend alors la valeur 10. Le résultat quant à lui prend la valeur du seuil de quantification. Echelle Absente Echelle Absente Code remarque utilisé pour le paramètre cote à l'échelle (code sandre paramètre [1429]) et indiquant que la lecture n'a pu être réalisée en raison de l'absence d'échelle. Le résultat de l'analyse doit être vide et le code remarque doit être [11]. Echelle non exploitable Echelle non exploitable Code remarque utilisé pour le paramètre cote à l'échelle (code sandre paramètre [1429]) et indiquant que la lecture n'a pu être réalisée car l'échelle est présente mais elle n'est pas exploitable (cassée, illisible, ...). Le résultat de l'analyse doit être vide et le code remarque doit être [12]. Nombre de supports prélevés Le nombre de supports prélevés indique le nombre de supports d’un substrat donné pris en compte dans un même prélèvement élémentaire biologique. Cette information est essentiellement utilisée pour les protocoles Diatomées pour indiquer le nombre de cailloux,... prélevés sans avoir à déclarer autant de prélèvements élémentaires biologiques, ce qui alourdirait la base et la saisie sans apporter d’information supplémentaire. Lorsque plusieurs supports sont ainsi regroupés dans un même prélèvement élémentaire, les attributs de description du prélèvement élémentaire (hauteur d’eau par exemple) rendent compte des valeurs les plus pertinentes (moyennes, mini, maxi selon les cas) des différents substrats. Si l’usage de telles valeurs globales ne rend pas compte de la réalité, il est alors nécessaire de déclarer plusieurs prélèvements élémentaire pour détailler ces valeurs.. Stabilité du substrat Le préleveur peut indiquer la stabilité du substrat de la placette au moment du prélèvement selon les valeurs définies dans la nomenclature n°57. Ignoré Ignoré Stable Stable Moyennement Moyennement stable Instable Instable