APT urn:sandre:dictionnaire:sa_apt::2.0 Référentiel taxonomique 2011 2.0 Référentiels France fra 2011-02-21 2011-02-21 2011-04-13 Evolution 1.1 de Taxon (TAX) -> Appellation taxonomique (APT) 2.0 - Ajout du concept "APPELLATION DU TAXON" - Ajout de lien entre "APPELLATION DU TAXON" et "TAXON" - Ajout de l'associaton "Est synonyme de" - Suppression du concept "SYNONYME" - Suppression de l'attribut "biovolume" - Modification de "GROUPE DE TAXONS" qui devient "REGROUPEMENT DE TAXONS" Validé -----------------Entités----------------- APPELLATION DU TAXON Désignation d'un taxon qui est une unité générique qui fait référence à la systématique - forme de classification dérivant du même ancêtre. Selon qu'on remonte plus ou moins haut dans l'origine du taxon, on aura des taxons supérieurs (embranchements, classes) ou des taxon inférieurs (genres, espèces, races). Il arrive que la découverte d'un taxon attribuée à un chercheur soit remise en cause par un autre, ce qui conduit à une appellation d'un taxon à être vue comme : - "référente" vis à vis d'autres appellations synonymes, - "synonyme" d'une autre appellation référente. La liste des appellations des taxons est administrée par le SANDRE. Code de l'appellation du taxon Nom latin de l'appellation du taxon Statut de l'appellation du taxon Date de création de l'appellation du taxon Date de la dernière mise-à-jour de l'appellation du taxon Rédacteur de la fiche de l'appellation du taxon Références bibliographiques de l'appellation du taxon Commentaires sur l'appellation du taxon Auteur de l'appellation du taxon Niveau taxonomique du taxon Thème du taxon Est un élément de regroupement de taxons Est synonyme Noms communs de l_appellation du taxon Est un élément de Code alternatif du taxon Est synonyme CODE ALTERNATIF Code associé à l'appellation du taxon, différent de celui de l'entité "APPELLATION DE TAXON" et par lequel un utilisateur peut accéder à une occurrence de cette dernière entité. Il ne s'agit pas de prendre en compte toutes les codifications qui existent mais de concilier des approches différentes. A titre d'exemple, il existe une codification des poissons et des diatomées qui est rentrée dans les moeurs; elle ne peut être ignorée par le SANDRE. Afin de rapprocher le réfrentiel national des taxons à celui des banques de données, il est nécessaire de pouvoir établir des correspondances. Identifiant du code alternatif Code alternatif Origine du code alternatif Code alternatif du taxon THEME DES TAXONS Classification des appellations des taxons suivant leur nature et les utilisations qui en sont faites. La liste des thèmes des appellations taxons relève de la responsabilité du SANDRE. Les thèmes sont décrits dans la nomenclature n°121. Code du thème des taxons Libellé du thème des taxons Thème du taxon NIVEAU TAXONOMIQUE Classification hiérarchique des appellations des taxons, chaque niveau systématique est défini dans la nomenclature n°222. La liste des niveaux taxonomiques est sous la responsabilité du SANDRE. Abréviation taxonomique Niveau taxonomique Niveau taxonomique du taxon REGROUPEMENT DE TAXONS Un regroupement de taxons est un ensemble de taxons présentant des caractéristiques communes. Les critères permettant de définir des regroupements de taxons peuvent être complexes et multiples. Ces critères sont en rapport avec la finalité pour laquelle un regroupement de taxons est défini. Un regroupement de taxons peut contenir plusieurs sous-regroupements, selon un ordre hiérarchique pouvant aller jusqu'à plusieurs niveaux inférieurs. Un regroupement de taxons peut être rattaché à plusieurs regroupements de taxons parents. Les différents regroupements de taxons sont administrés par le Sandre. Code du regroupement de taxons Nom du regroupement de taxons Libellé court du regroupement de taxons Libellé long du regroupement de taxons Statut du regroupement de taxons Définition du regroupement de taxons Date de création du Regroupement de taxons Auteur de la demande de création du Regroupement de taxons Date de dernière mise à jour du regroupement de taxons Commentaires sur le regroupement de taxons Association entre groupes de taxons Association entre groupes de taxons regroupement de taxons NOM COMMUN DE L'APPELLATION DU TAXON Appellation la plus couramment utilisée pour désigner le taxon. Le renseignement de cette donnée est facultatif car un taxon ne possède pas systématiquement de nom commun. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Libellé du nom commun de l'appellation du taxon Noms communs de l_appellation du taxon TAXON Le taxon est une unité générique qui fait référence à la systématique. Cette science établit une classification des êtres vivants à partir de critères de ressemblance suivant une structure arborescente et hiérarchique à plusieurs niveaux (règne, embranchement, ordre, famille, genre, espèce...) dont chaque élément ou composante est qualifié de taxon. La liste des taxons est administrée par le SANDRE. Code du taxon Nom latin du taxon Statut du taxon Date de création du taxon Date de la dernière mise-à-jour du taxon Rédacteur de la fiche sur le taxon Nom commun du taxon Références bibliographiques sur le taxon Commentaires sur le taxon Auteur du taxon -----------------Attributs----------------- Code de l'appellation du taxon Identifiant non signifiant de l'appellation du taxon attribué par le SANDRE. Nom latin de l'appellation du taxon Designation latine également qualifiée de nom scientifique de l'appellation du taxon. Pour éviter toute confusion à propos des espèces, celles-ci auront comme nom latin la composition du nom latin de l'espèce et du nom latin du genre. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive de l'appellation du taxon. Statut de l'appellation du taxon Degré de validité d'une appellation du taxon affecté par le SANDRE. La liste des valeurs autorisées est définie par le Sandre dans la nomenclature n°390. Gelé Gelé Une nomenclature ou un élément codifié d'une liste nationale SANDRE possède un statut GELE lorsqu'il a fait l'objet d'un travail de vérification de sa pertinence par un groupe d'experts du SANDRE, au regard des listes de références existantes. La conclusion de ce travail a mis en évidence une ou plusieurs erreurs pouvant être de nature variée (redondance d'informations, informations incomplètes, confusion) qui n'autorisent pas son usage au sein d'échanges de données. Une nomenclature ou une occurrence de listes nationales de statut gelé peut en outre évoluer à l'avenir vers un statut valide, toujours selon l'avis de groupes d'experts. Validé Validé Une nomenclature ou un élément codifié d'une liste nationale SANDRE possède un statut VALIDE lorsqu'il a été jugé pertinent et cohérent aux yeux d'un groupe d'experts, garantissant ainsi son caractère valide. La nomenclature ou l'occurrence de listes nationales est bien reconnu officiellement par le SANDRE et PEUT désormais faire l'objet d'échanges de données. Date de création de l'appellation du taxon Indication du jour, du mois et de l'année, à laquelle l'appellation du taxon a été créé dans la liste nationale des appellation de taxons. L'affectation d'une date de création relève de la responsabilité du SANDRE. Date de la dernière mise-à-jour de l'appellation du taxon Indication du jour, du mois et de l'année, de la dernière mise-à-jour validée des informations portées sur la fiche de description de l'appellation du taxon. L'affectation de la date de la dernière mise-à-jour relève de la responsabilité du SANDRE. Rédacteur de la fiche de l'appellation du taxon Premier organisme à avoir demandé au SANDRE l'enregistrement de l'appellation du taxon. Le renseignement de cette donnée est obligatoire. Cet attribut ne sera pas actualisé à la suite des actualisations éventuelles de la fiche de description de l'appellation du taxon. L'attribution d'un auteur à un taxon relève de la responsabilité du SANDRE. Références bibliographiques de l'appellation du taxon Sources documentaires ou autres qui contiennent toutes les informations nécessaires quant à l'identification et la détermination de l'appellation du taxon. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'une nouvelle appellation du taxon auprès du SANDRE qui en a la responsabilité. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche de description de l'appellation du taxon. . Commentaires sur l'appellation du taxon Ensemble des informations complémentaires relatif à l'appellation du taxon qu'il peut être intéressant de porter à la connaissance du lecteur et qui ne sont pas formalisées dans la fiche de l'appellation du taxon. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'une nouvelle apellation de taxon auprès du SANDRE qui en a la responsabilité. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche de description de l'appellation du taxon. . Auteur de l'appellation du taxon Nom de la personne qui décrit le première fois de l'appellation du taxon suivi de l'année de la description. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'une nouvelle appellation du taxon auprès du SANDRE qui a en la responsabilité. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive de l'appellation du taxon. Identifiant du code alternatif Indication qui identifie de façon unique le code alternatif ; il est artificiel et non signifiant. Il est justifié par le fait qu'un code alternatif ne peut être identifiant de cette entité. En effet, un code alternatif n'est pas obligatoirement unique puisqu'il peut identifier une ou plusieurs occurrences différentes de l'entité APPELLATION DE TAXON dans au moins deux contextes différents. Code alternatif Valeur du code associé à une appellation de taxon dans un contexte particulier (Banque Hydrobiologique et Piscicole, Code Poisson, ...). Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'une nouvelle appellation de taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises à jour successives de la fiche descriptive de l'appellation du taxon. Origine du code alternatif Contexte dans lequel le code alternatif est couramment employé. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'une nouvelle appellation de taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises à jour successives de la fiche descriptive de l'appellation du taxon. La liste des valeurs possibles est définie dans la nomenclature n°XXX. Code du thème des taxons Identifiant attribué à chaque thème tel que défini dans la nomenclature Sandre n°121. La liste des thèmes des appellations des taxons relève de la responsabilité du SANDRE. Libellé du thème des taxons Nom attribué à chaque thème tel que défini la nomenclature n°121. La liste des thèmes des appellations des taxons relève de la responsabilité du SANDRE. Inconnu Thème inconnu Poissons Poissons Végétaux Végétaux Invertébrés benthiques Invertébrés benthiques Micro-organismes Micro-organismes Diatomées Diatomées Reptiles Reptiles Batraciens Batraciens Mammifères Mammifères Cyanobactéries Cyanobactéries Taxon haut niveau Taxon de haut niveau Abréviation taxonomique Code attribué à chaque niveau systématique tel que défini dans la nomenclature n°222. La liste des niveaux taxonomiques est sous la responsabilité du SANDRE. R Règne E Embranchement sE Sous-Embranchement SCL Super-Classe CL Classe sCL sous-Classe SO Super-Ordre O Ordre sO Sous-Ordre SF Super-Famille F Famille sF Sous-Famille T Tribu G Genre sG Sous-Genre sp Espèce ssp Sous-Espèce iO infra-Ordre iF infra-Classe V Variété sV Sous-variété Fo Forme sFo Sous-forme sR Sous-Règne Sec Section sSc Sous-Section iR Infra-Règne iE Infraembranchement Niveau taxonomique Libellé de chaque niveau systématique tel que défini dans la nomenclature n°222. La liste des niveaux taxonomiques est sous la responsabilité du SANDRE. R Règne E Embranchement sE Sous-Embranchement SCL Super-Classe CL Classe sCL sous-Classe SO Super-Ordre O Ordre sO Sous-Ordre SF Super-Famille F Famille sF Sous-Famille T Tribu G Genre sG Sous-Genre sp Espèce ssp Sous-Espèce iO infra-Ordre iF infra-Classe V Variété sV Sous-variété Fo Forme sFo Sous-forme sR Sous-Règne Sec Section sSc Sous-Section Code du regroupement de taxons Identifiant unique non signifiant du regroupement de taxons. Il est administré par le Sandre. Nom du regroupement de taxons Appellation commune du regroupement de taxons. Cet attribut peut comporter des abréviations explicites. Libellé court du regroupement de taxons Diminutif, de préférence unique, du regroupement de taxons. Cet attribut créé à des fins d'exploitation informatique peut contenir des sigles ou des abréviations explicités dans le nom du regroupement de taxons. Libellé long du regroupement de taxons Nom long du regroupement de taxons. Cet attribut créé à des fins d'exploitation informatique peut contenir des sigles ou des abréviations explicités dans le nom du regroupement de taxons. Statut du regroupement de taxons Degré de validité d'un regroupement de taxons affecté par le SANDRE. La liste des valeurs autorisées est définie par le Sandre dans la nomenclature n°390. Gelé Gelé Une nomenclature ou un élément codifié d'une liste nationale SANDRE possède un statut GELE lorsqu'il a fait l'objet d'un travail de vérification de sa pertinence par un groupe d'experts du SANDRE, au regard des listes de références existantes. La conclusion de ce travail a mis en évidence une ou plusieurs erreurs pouvant être de nature variée (redondance d'informations, informations incomplètes, confusion) qui n'autorisent pas son usage au sein d'échanges de données. Une nomenclature ou une occurrence de listes nationales de statut gelé peut en outre évoluer à l'avenir vers un statut valide, toujours selon l'avis de groupes d'experts. Validé Validé Une nomenclature ou un élément codifié d'une liste nationale SANDRE possède un statut VALIDE lorsqu'il a été jugé pertinent et cohérent aux yeux d'un groupe d'experts, garantissant ainsi son caractère valide. La nomenclature ou l'occurrence de listes nationales est bien reconnu officiellement par le SANDRE et PEUT désormais faire l'objet d'échanges de données. Définition du regroupement de taxons Enoncé qui permet une bonne compréhension du contenu du regroupement de taxons. Date de création du Regroupement de taxons Indication du jour, du mois, de l'année, à laquelle un regroupement de taxons a été créé. L'affectation d'une date de création relève de la responsabilité du Sandre. Auteur de la demande de création du Regroupement de taxons Premier organisme à avoir demandé au Sandre l'enregistrement du regroupement de taxons. L'attribution d'un auteur à un regroupement de taxons relève de la responsabilité du Sandre. Date de dernière mise à jour du regroupement de taxons Indication du jour, du mois et de l'année , de la dernière mise à jour validée des informations portées sur la fiche de description ou sur le contenu du regroupement de taxons en question. L'affectation de la date de la dernière mise-à-jour à un regroupement de taxons relève de la responsabilité du Sandre. Commentaires sur le regroupement de taxons Informations supplémentaires relatives au regroupement de taxons et qu'il peut être intéressant de porter à la connaissance du lecteur. Libellé du nom commun de l'appellation du taxon Appellation la plus couramment utilisée pour désigner le taxon. Le renseignement de cette donnée est facultatif car un taxon ne possède pas systématiquement de nom commun. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Code du taxon Identifiant non signifiant attribué par le SANDRE. Nom latin du taxon Appellation latine également qualifiée de nom scientifique. Pour éviter toute confusion à propos des espèces, celles-ci auront comme nom latin la composition du nom latin de l'espèce et du nom latin du genre. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Statut du taxon Degré de validité d'un taxon affecté par le SANDRE. La liste des valeurs autorisées est définie par le Sandre dans la nomenclature n°390. Gelé Gelé Une nomenclature ou un élément codifié d'une liste nationale SANDRE possède un statut GELE lorsqu'il a fait l'objet d'un travail de vérification de sa pertinence par un groupe d'experts du SANDRE, au regard des listes de références existantes. La conclusion de ce travail a mis en évidence une ou plusieurs erreurs pouvant être de nature variée (redondance d'informations, informations incomplètes, confusion) qui n'autorisent pas son usage au sein d'échanges de données. Une nomenclature ou une occurrence de listes nationales de statut gelé peut en outre évoluer à l'avenir vers un statut valide, toujours selon l'avis de groupes d'experts. Validé Validé Une nomenclature ou un élément codifié d'une liste nationale SANDRE possède un statut VALIDE lorsqu'il a été jugé pertinent et cohérent aux yeux d'un groupe d'experts, garantissant ainsi son caractère valide. La nomenclature ou l'occurrence de listes nationales est bien reconnu officiellement par le SANDRE et PEUT désormais faire l'objet d'échanges de données. Date de création du taxon Date exprimée au jour près, à laquelle un taxon a été créé dans la liste nationale des taxons. L'affectation d'une date de création à un taxon relève de la responsabilité du SANDRE. Date de la dernière mise-à-jour du taxon Date exprimée au jour près, de la dernière mise-à-jour validée des informations portées sur la fiche de description du taxon. L'affectation de la date de la dernière mise-à-jour à un taxon relève de la responsabilité du SANDRE. Rédacteur de la fiche sur le taxon Premier organisme à avoir demandé au SANDRE l'enregistrement du taxon. Le renseignement de cette donnée est obligatoire. Cet attribut ne sera pas actualisé à la suite des actualisations éventuelles de la fiche. L'attribution d'un auteur à un taxon relève de la responsabilité du SANDRE. Nom commun du taxon Nom le plus couramment utilisé pour désigner le taxon. Le renseignement de cette donnée est facultatif car un taxon ne possède pas systématiquement de nom commun. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Références bibliographiques sur le taxon Sources documentaires ou autres qui contiennent toutes les informations nécessaires quant à l'identification et la détermination du taxon. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Commentaires sur le taxon Ensemble des informations complémentaires relatif au taxon qu'il peut être intéressant de porter à la connaissance du lecteur et qui ne sont pas formalisées dans la fiche taxon. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon. Auteur du taxon Nom de la personne qui décrit le première fois le taxon suivi de l'année de la description. Cette information est fournie par le ou les organismes qui déposent une demande d'enregistrement d'un nouveau taxon auprès du SANDRE qui a la responsabilité de la liste des taxons. Cette information peut être complétée par les mises-à-jour successives de la fiche descriptive du taxon.